Бухара — один из городов, чья история уходит в неизвестность. Впервые письменные упоминания появились у китайских путешественников во II веке до нашей эры. До этого, сведения о городе или заселенной области упоминаются лишь устно, в легендах и преданиях. Так, например, по одной из легенд, иранский принц Сиявуш прибыл в эти края, и женился на дочери царя Афрасиаба, после того как выполнил условие царя, построив целую крепость на одной шкуре быка.

С другой стороны, исторически сложилось так, что Бухара имела много названий, и было много попыток объяснить название города. Китайцы называли его Пу Хо, или Ну Ми. Были вариации нынешнего названия Бихара, Бухар. Бухар – у китайцев и уйгуров означало «место идолов», а Бихара – в переводе с санскрита означает «монастырь». Поэтому нельзя с уверенностью утверждать ту или иную версию зарождения поселения и его названия. Сейчас возраст Бухары определили в 2500 лет, подтверждением которого являются культурные наслоения достигающие глубины в 20 метров. Хронологически история города начинается с захвата этого региона персидским царем Киром в VI веке до нашей эры. Господство продолжалось 3 века до прихода сюда войск Александра Македонского. К этому времени (329 год до н.э.) Бухара уже была городом, центром которого стала крепость Арк. Через город проходил Великий Шелковый Путь, благодаря чему уже тогда здесь было более 60 караван-сараев, в которых отдыхали караваны из Китая, Индии, и других стран Востока. В I веке до нашей эры Бухара входила в состав Кушанского царства, затем перешла под контроль государства эфталитов, а в VI-VII веках вошла в состав Западного тюркского каганата. В начале VII веке происходит переломный момент в истории Бухары – город захватывают арабы, которые в итоге покоряют практически всю Центральную Азию. Повсеместно насаждается ислам, распространение которого и стало причиной оккупации арабами. Но среди местного населения поднимается восстание, которое получило название «Движение людей в белых одеждах», предводителем которого стал Хашим-ибн-Хаким (Муканна). Восстание было жестоко подавлено, но арабы опасаясь новых волнений передали местную власть бухарской аристократии. В IX веке в городе начинаются положительные изменения, – к власти приходит династия Саманидов, которые делают Бухару столицей своего огромного государства. Город растет, появляются новые мечети, базары, жилые кварталы. А вокруг города строится новая крепостная стена с 11 главными воротами. В Х веке для Бухары наступает эпоха развитой науки и культуры: в городе работают ведущие ученые, поэты, философы, художники и многие другие. Среди них особо выделяется Абу Али ибн Сина, называемый в Европе Авиценной. Наряду с ним здесь работают поэт Рудаки, Дакики, Наршахи, Табари, В XI-XII веках Бухара была завоевана кочевыми племенами, – сначала здесь правили караханиды, а на смену им пришли кара-китаи. Этот период стал одним самых тяжелых в истории Бухары, и население города не выдержав этот гнет, подняло крупное восстание, которое возглавил Малик Санджар. Этим воспользовалось соседнее государство Хорезм-шахов, и подавив восстание установило здесь свою власть.

Однако, вскоре наступили еще худшие времена, город был захвачен войсками Чингизхана. Город был разграблен, а население было уведено в Монголию, в рабство. Но город постепенно восстановился, а побывавший здесь Марко Поло, описал Бухару как город большого величия. Власть монголов слабела, и в 1370 году город перешел под контроль государства Тимуридов. Город потерял свой политический статус, так как столицей государства был Самарканд, но при Мирзо Улугбеке здесь образовался крупный культурный центр Азии. В 1506 году Бухара была захвачена Шейбанидами. За 50 лет они перенесли сюда столицу из Самарканда, и было образовано государство, впоследствии названное Бухарским ханством. Такое название сохранялось на протяжение почти 4 веков. Династии меняли друг друга, расцвет города сменялся упадком, это было время больших перемен. Во второй половине XIX века Россия начала экспансию в Центральную Азию, в ходе которой было завоевано Бухарское ханство. Однако эмир Бухары добился перемирия, и Российская империя установила протекторат над ханством. Город получил новое развитие, была проведена железная дорога, начался постоянный приток предпринимателей и рабочих из России. В период российских революций вспыхнула Бухарская народная революция, в результате которой был свергнут эмир и создана Бухарская Народная Советская Республика. В 1924 году была создана Узбекская ССР, и Бухара вошла в ее состав, как административный центр Бухарской области. Сегодня, после объявления Независимости Узбекистана, Бухара остается центром Бухарской области в составе Республики Узбекистан. Город утратил роль крупного торгового и культурного центра, и стал одним из ведущих туристических центров страны.