Тела убитых сброшены в одну из шахт рудника. Трагедия произошла на следующий день после расстрела царской семьи. С первых дней прихода к власти большевики не только продолжили политику Временного правительства по уничтожению символики царского самодержавия, но и приступили к ликвидации членов семьи Романовых. Князья и княгини были сосланы из Петрограда сначала в Пермь, потом в Екатеринбург, затем в Алапаевск. Всем заключенным были выданы удостоверения личности с правом передвижения «только по Алапаевску», для выхода из здания было достаточно уведомить разводящего караула. Им разрешалось вести переписку, посещать церковь, гулять в поле возле школы. Поводом для ужесточения режима стал инсценированный большевиками побег великого князя Михаила Александровича, в ночь на 13 июня 1918 года. Предпринимаемые меры уральские большевики согласовывали с Москвой и Петроградом. У членов семьи Романовых было конфисковано все их имущество. Оставлены только одежда, которая была на них, обувь и две смены белья. В ночь на 18 июля 1918 года узники вывезены в неизвестном направлении, после чего вскоре появились сведения об их смерти. В сентябре 1918 года Алапаевск перешёл под контроль адмирала Колчака. По факту смерти узников было начато расследование. Следствием установлено, что в ночь на 18 июля под предлогом перевода заключенных из Алапаевска в Верхне-Синячихинский завод к зданию школы прибыла группа рабочих Невьянского и Верхне-Синячихинского заводов во главе с Петром Старцевым.

Узников вывезли за город к одной из заброшенных шахт железного рудника Нижняя Селимская и после удара обухом топора по голове сбрасывали в шахту. Затем шахту забросали гранатами, завалили жердями, бревнами и присыпали землей.