Взято с ФБ.

Автор Kirill Metelkin
Вероятность появления брака по окрасу. Часть 2.
В первой части было показано, что вероятность возникновения брака по окрасу не коррелирует со знаками «+», «!», «-» рекомендательной таблицы из Приложения к ПП РКФ для породы немецкий шпиц (далее – ПП). Но не был рассмотрен очень важный момент – не была учтена так называемая борьба с «повышением в популяции гетерозиготности по нежелательным цветовым сочетаниям». Данная формулировка несколько сбивает с толку, потому что относится к таблице из первой редакции. Сказано, что борьба направлена на уменьшение количества гетерозиготных состояний в НЕЖЕЛАТЕЛЬНЫХ сочетаниях, что соответствует обозначению ДОПУСТИМО «!» в новой редакции. Например, для сочетания черный Х оранжевый, черный не должен нести такие пары как Bb, Ee, Kky, а оранжевый не должен нести следующие пары: Kky, Bb. Если перефразировать относительно новой редакции, то фраза будет звучать следующим образом: «борьба с повышением в популяции гетерозиготности по допустимым цветовым сочетаниям». Основной смысл данной фразы - уменьшить гетерозиготность и спокойно осуществлять вязки в рекомендованных и допустимых сочетаниях. Велика ли вероятность получения брака в сочетаниях гетерозигот для различных окрасов? Для того чтобы это понять, необходимо произвести скрещивания носителей коричневого гена для различных окрасов.
Рассмотрим два случая. В первом случае носительство коричневого гена будет однозначно определено только у одного представителя. Во втором случае носительство коричневого гена будет однозначно определено у обоих представителей.
Вариант 1
Методика расчетов аналогична приведенной в первой части статьи. Берем виртуального представителя одного окраса из таблицы ПП и скрещиваем его с другим виртуальным представителем другого или того же окраса. Известно, что генетических комбинаций для каждого окраса в рамках ограниченного количества исследуемых локусов будет определенное количество. Например, если взять 5 локусов, состав которых был определен в первой части статьи, то тогда для черного окраса число различных комбинаций будет равно 360. Если из этого количества отобрать носителей коричневого, то их число уменьшится до 180. То есть останутся следующие комбинации:
[['at', 'at'], ['B', 'b'], ['E', 'e'], ['i', 'i'], ['K', 'ky']];
[['aw', 'aw'], ['B', 'b'], ['E', 'e'], ['I', 'i'], ['K', 'ky']];
[['ay', 'aw'], ['B', 'b'], ['Em', 'e'], ['I', 'I'], ['K', 'K']];
и т.д.
Скрещивание производиться следующим образом: у одного представителя будет однозначно определено носительство коричневого гена, а у другого представителя будут задействованы все равновероятные комбинации (полный набор комбинаций). Другими словами один представитель тестирован, а другой нет. Это случай, когда ПП рекомендует не осуществлять вязки черных с остальными окрасами - носителями коричневого гена (по результатам генетического теста на локус B или знанию генотипа).
Принцип, по которому рассчитывается вероятность получения тех или иных окрасов для каждой скрещиваемой пары, был описан в первой части статьи.
В результате расчетов получены вероятности получения брака по окрасу для различных сочетаний. Все данные были сведены в таблицу 2.1. В полученной таблице в каждой ячейке присутствует 2 строки. В первой строке указан знак в соответствии с рекомендациями к ПП РКФ («-» - крайне нежелательно, «!» - допустимо, «+» - рекомендовано), во второй указана расчетная вероятность получения брака по окрасу в рамках описанной модели. Таблица заполнена наполовину по причине того, что значения повторяются для одинаковых пар окрасов. То есть, нет разницы, скрещивается черный с оранжевым или оранжевый с черным. Коричневый из таблицы также исключен и перенесен в таблицу для второго варианта, так как коричневый окрас подразумевает носительство коричневого гена, а скрещивание коричневого представителя с не носителями коричневого рассматривалось в первой части статьи. В названиях строк таблицы указаны окрасы с носительством коричневого гена, а в названиях столбцов указаны окрасы с полным набором равновероятных комбинаций.
Далее можно перейти к наблюдениям и сделать выводы.
1. Вероятность получения брака в сочетаниях черного (носителя коричневого) с остальными окрасами (весь набор равновероятных комбинаций) ниже, чем при вязках между представителями группы «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (носителями коричневого) и представителями группы «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (весь набор комбинаций).
2. Вероятность получения брака в сочетаниях черного (носителя коричневого) с остальными окрасами (весь набор комбинаций) ниже, чем в сочетании коричневый Х коричневый (9.3%) из первой части статьи.
3. Самая низкая вероятность получения брака в сочетании черно-подпалого (носителя коричневого) с черно-подпалым (не носителем коричневого), это обусловлено тем, что в данной модели принято, что коричнево-подпалый не является браком и признан в системе РКФ.
Данные расчеты еще раз подтверждают, что вязки черных представителей со всеми окрасами, даже с носительством коричневого одного из представителей, дают наименьшую вероятность появления брака в помете. Разрабатывая рекомендации, стоило указать, что для представителей группы «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (носителей коричневого), вязки рекомендуется осуществлять с представителями черного окраса. В данных сочетаниях вероятность появления брака по окрасу минимальна. Носительство коричневого определять по следующим признакам: один из родителей коричневый; сделан генетический тест на локус B; при осуществлении тестовых вязок от данного представителя были получены щенки коричневого окраса или с коричневой пигментацией. Также значения вероятности порядка 10 % не являются критическими и не могут трактоваться в пользу введения резких ограничений на вязки отдельных окрасов, таких как коричневый. Это приведет к уменьшению поголовья редких окрасов, а в случае достижения критического уровня, к полному их вырождению.
Вариант 2
В этом варианте рассматриваются сочетания, когда у обоих представителей будет однозначно определено носительство коричневого гена (Таблица 2.2). Этот случай в ПП относительно всех окрасов вообще не рассматривался. Указаны лишь строгие ограничения на осуществление вязок коричневых с окрасами из группы «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» носителями коричневого. Точнее необходимо согласовывать такие вязки с ПК РКФ, но это равносильно введению серьёзных ограничений.
Наблюдения и выводы по таблице 2:
1. Вероятность получения брака в сочетаниях черного (носителя коричневого) с остальными окрасами (носителями коричневого) ниже, чем при вязках между представителями группы «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (носителями коричневого).
2. Вероятность получения брака в сочетаниях черного (носителя коричневого) с остальными окрасами (носителями коричневого) ниже, чем в сочетании коричневый Х коричневый (9.3%) из первой части статьи.
3. Вероятность получения брака в сочетании коричневого с группой окрасов «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (носителей коричневого) ниже, чем в сочетании между окрасами из группы «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (носителей коричневого) и составляет порядка 13%.
4. Вероятность получения брака, порядка 20 % возникает в сочетаниях для группы окрасов «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (носители коричневого).
5. Самая низкая вероятность получения брака в сочетании черно-подпалых (носителей коричневого), это обусловлено тем, что в данной модели принято, что коричнево-подпалый не является браком и признан в системе РКФ.
В ПП стоило бы указать, что для окрасов из группы «оранжевый, кремовый, соболиный, волчий» (носителей коричневого) рекомендуется осуществлять вязки в сочетании с черным. А носительство коричневого определялось бы исходя из того факта, что один из родителей коричневый, или сделан генетический тест, или при осуществлении тестовых вязок от данного представителя были получены щенки коричневого окраса или с коричневой пигментацией.
Стоит обратить внимание на тот факт, что популяция представителей коричневого окраса очень не многочисленна. Введя весовой коэффициент в данную модель можно показать, что влияние на популяцию гетерозигот по локусу B будет также незначительной.
Подводя итог можно однозначно определить, что рекомендации необходимо дорабатывать как по текстовой части, так и по табличной. Также необходимо сбалансировать рекомендации, таким образом, чтобы они не были направлены на уничтожение отдельных окрасов в породе.
Заводчик сам должен оценивать вероятность получения брака в рамках своей программы разведения. Но при этом, должны быть созданы инструменты, помогающие в этом деле. Должен быть качественный подход к созданию материалов и инструментов помощи. При разработке рекомендаций должно быть проведено всестороннее исследование, учтены все нюансы. В результате должен получиться комплекс мер, который будет направлен на минимизацию необдуманных вязок, но при этом не должно создаваться условий для сокращения генофонда тех или иных окрасов.
Задача:
Определить окрасы и вероятность их возникновения для скрещивания:
Коричневый [['at', 'at'], ['b', 'b'], ['E', 'E'], ['I', 'i'], ['K', 'ky']]
Х
Кремовый [['at', 'at'], ['B', 'b'], ['e', 'e'], ['i', 'i'], ['ky', 'ky']]