Если у вас перестал работать skypeforlinux (64 разрядный, бета) после обновления - просто удалите и поставьте снова.

Причина в неисправимой ошибке уже установленного пакета. Приносим извинения за неудобства.
А хорошая новость в том, что теперь пакет рабочий и не требуется установка с официального сайта, все опять ставится из репозиториев.