Специальная гоночная версия ŠKODA 966 Supersport с алюминиевым кузовом была выпущена в 1950 году.

Вскоре было построено еще два экземпляра: один для участия в гонках и один - запасной, который впоследствии и попал в музей ŠKODA. Последний раз машины типа 966 Supersport принимали участие в гонках в 1962 году и впоследствии две из трех были потеряны, а третья долгое время хранилась у словацкого гонщика Ивана Мичика. В 2007 году реставрационная мастерская музея ŠKODA приобрела машину и началась работа по долгому и тщательному восстановлению болида. Наконец, ŠKODA 966 Supersport в цветах сезона 1953 года заняла достойное место среди экспонатов музея в Млада Болеславе.