Вишня Харитоновская была выведена в конце XX века селекционерами ВНИИГиСПР имени И.

В. Мичурина в городе Мичуринске Тамбовской области путём скрещивания популярного сорта Жуковская с церападусом Алмаз. От Жуковской она унаследовала крупные плоды и хороший вкус, а от Алмаза — повышенную устойчивость к грибковым заболеваниям. Сорт Харитоновская районирован с 1998 года для Центрально-Чернозёмного региона.
Церападусы — результат отдалённой гибридизации вишни обыкновенной с японской черёмухой Маака. Отличаются генетически обусловленной невосприимчивостью к коккомикозу и передают эту особенность своим потомкам, что широко используется селекционерами для получения современных болезнестойких сортов вишни.