Расцветка и композиция флага Забайкалья взяты с исторического герба региона середины XIX века. Цвета флага имеют геральдическую и географическую трактовку: Желтый означает бескрайние степи Забайкалья, а также символизирует справедливость и богатство; Зеленый – богатство таежной природы, символ надежды и изобилия; Красный олицетворяет энегоресурсы, мужество и неустрашимость.