Саб-Зиро и Смоук вернулись в Лин Куэй.

Пока они были во Внешнем Мире в их клане произошли крупные изменения — технологический прорыв сделал возможным трансформацию людей в киборгов. Двое членов клана Сектор и Сайракс вызвались добровольно принять участие в эксперименте и стать первыми киберубийцами Лин Куэй. Саб-Зиро и Смоук были выбраны для трансформации в машины. Они попытались сбежать из штаб-квартиры клана, но только Саб-Зиро удалось это сделать. Смоук был пойман и насильно превращён в киборга. Сбежав из клана, Саб-Зиро опозорил Лин Куэй и за это был приговорён к смерти. Все трое киборгов, Сектор, Сайракс и Смоук, получили задание найти и уничтожить воина предателя.
После победы земных воинов, Земное Царство было отделено от Внешнего Мира. Саб-Зиро на некоторое время ушёл в тень, а его клан частично распался.
Сектор, чья программа была повреждена в схватке с воинами Шао Кана во время вторжения, решил убить лидера Лин Куэй и захватить контроль над кланом. Ему успешно удалось убить лидера, но Саб-Зиро победил Сектора в тяжёлой битве и сорвал планы киборга по захвату Лин Куэй. Сектор бежал в Японию, где создал свой клан кибернетических ниндзя - Текунин. Саб-Зиро получил контроль над кланом и решил превратить его из организации наёмных-убийц, в организацию, служащую Земному Царству, состоящую из тренированных воинов, которые могли бы помочь землянам в случае нашествия тёмных сил. Он перенёс штаб-квартиру клана в Арктику в заброшенный храм могущественной провидицы Делии. Также Саб-Зиро получил Медальон Дракона, символизирующий власть над кланом, который многократно увеличил его силы.
Саб-Зиро устроил турнир в новом Лин Куэй. Победительницей стала девушка-воин по имени Фрост, которая обладала такими же замораживающими способностями, как и Саб-Зиро. По традициям Лин Куэй, Саб-Зиро сделал её своей личной ученицей. Он помог ей лучше управлять своими замораживающими силами, но Фрост не разделяла его взглядов и была заносчивой и высокомерной.