Из-за огромного количества чакры, которую он частично получает от запечатанного Кьюби, Наруто способен использовать крайне мощные техники в больших количествах, будь то массовое Каге Буншин но Дзюцу или огромное количество Расенганов.

Также Наруто доступны стандартные техники шиноби, равно как и некоторые самостоятельно созданные приёмы Тайдзюцу.
Таджу Каге Буншин но Дзюцу - запретная техника ранга А. Наруто выучил ее за несколько минут. Ему никто не помогал, он изучал эту технику самостоятельно, из мотивации стать Генином и приблизиться к своей мечте - стать Хокаге. Расенган тоже является техникой ранга А, которую Наруто изучил во время тренировок с Джирайей-сенсеем. Эта техника найчила Наруто отличному контролю формы чакры. Через некоторое время он изобретает свою технику, которая по существу базируется на контроле типа чакры.
Таким образом Наруто овладевает Футоном, контролем элемента чакры, и ему удается соединить этот комплексный метод манипуляции чары с Расенганом и создать Футон: Расен Шурикен, объединяющий в себе контроль над формой и элементом чакры. Тренировки с Фукасаку на Мёбокузане дали ему возможность создавать чакру с помощью природной энергии Сендзюцу. В режиме отшельника Наруто способен использовать очень сильные варианты Расенгана и даже бросать Футон: Расен Шурикен.
По словам Тоби, Наруто носит в себе невероятную физическую силу и силу чакры младшего воина, что даёт ему возможность входить в режим отшельника, а также огромную духовную силу. Таким образом Наруто тоже получил всю эту силу, будучи уроженцем великого клана Сенджу.
Режим Биджу
Позже Би и Наруто вновь входят в пещеру для того, чтобы Наруто научился использовать режим Биджу, режим полной трансформации в своего Биджу, однако это у него не получается, так как он и Кьюби не сотрудничают друг с другом. Хачиби объясняет Наруто, что пока Наруто находится в "режиме Чакры Кьюби", Биджу высасывает его Чакру, и если Наруто будет использовать Чакру Кьюби всё время, то может умереть (соответственно, массовое теневое клонирование под запретом, поскольку это многократно уменьшает временные возможности пребывания Наруто в этом режиме). После этого Наруто пытается компенсировать использование Имари, которым он не владеет, используя Расенган в режиме чакры девятихвостого.
После того как Наруто закончил тренировку у водопада правды и победил девятихвостого в себе, он способен использовать часть его чакры, однако на то время он не в полной мере мог контролировать те силы и способности, которые имеет.
На данный момент Наруто может уже в полной мере использовать потенциал режима чакры Кьюби: трансформироваться в окончательную форму режима Биджу и становиться невероятно сильным, однако лишь на некоторое время. В этой форме он способен издавать ревы, способные сдвинуть сразу несколько Биджу, при этом он не теряет контроль над собой и может действовать самовольно.