Нижний и верхний индексы размечаются тегами <sub> и <sup>.

Например, H₂O будет выглядеть так: H₂O.
Попрактиковаться и посмотреть на примеры можно в интерактивной главе «Разметка текста» — https://tml.io/xzrv6 Если вам нужно вставить очень сложную формулу в HTML-документ, лучше воспользоваться специальным языком разметки MathML.