«Богоматерь с младенцем» связана с важным эпизодом жизни Врубеля — пылкой и страстной любовью к жене Прахова — Эмилии. Именно она стала прообразом Богоматери: в ее лице легко улавливаются черты прекрасной, но эксцентричной Эмилии. Безответно влюбленный Михаил Врубель даже сделал ей предложение, но услышал от уже замужней женщины отказ. После этих событий Прахов отправил юного конкурента в Италию для знакомства со средневековым искусством и работами раннего Возрождения.