В программе мониторинга плодородия почв главное место занимает правильный выбор показателей, характеризующих физико-химические, биологические и иные свойства, определяющие уровень плодородия и качество почв.

Комплексный мониторинг состояния плодородия почв должен осуществляться путем сплошного обследования с использованием современных средств инструментально-аналитической и вычислительной техники.
Агрохимическое обследование позволяет проводить мониторинг изменения состава и свойств почвы, получить данные о ее плодородности, количестве доступных для растения элементов питания. Агрохимическое обследование проводят на всех типах сельскохозяйственных угодий.
Для получения достоверных данных агрохимического анализа, реально отражающих свойства почвы, кроме правильного отбора образцов в полевых условиях, нужна грамотная подготовка к анализам, правильное хранение образцов, наличие высокоточного оборудования и квалифицированных специалистов.
Современные методы анализа позволяют экспрессно определять 15 и более элементов питания в одной почвенной пробе, а также важные показатели – такие как кислотность и электропроводность почвы. На основании полученных в лаборатории результатов становится возможным рассчитать точные дозы вносимого удобрения, учитывая потребность в этом выращиваемой культуры; тип и структуру почвы; влияние климатических условий местности и иное влияние среды.