Изменения скорости плавания байкальских нерп совпадают с их активностью: в те месяцы, когда животные передвигаются на большие расстояния — возрастает и скорость перемещений. Результаты последнего изучения перемещений байкальской нерпы сотрудниками ФГБУН «ИПЭЭ РАН» при поддержке Фонда «Озеро Байкал» показывают, что молодые байкальские нерпы активно перемещаются в течение июля-сентября. 

По-видимому, это особенность молодых особей, которым свойственно «бродяжничество». Осенью, в октябре, двигательная активность нерп несколько понижается из-за формирования льдов. 

В ноябре-декабре активность их вновь увеличивается: нерпы расселяются по замерзающему Байкалу, и резко падает в январе-феврале — у нерп начинался «оседлый» ледовый период.

По сообщению рыбаков, нерпа попадала в сети на глубине до 200 м, но, как правило, она ныряет на значительно меньшие глубины.

В Байкальском лимнологическом музее ИНЦ СО РАН размещена информация, что нерпы живут на глубине до 300 м. Нерпа находит корм в хорошо освещённой зоне (25-30 м) и не имеет необходимости нырять глубоко.

Нерпа способна погружаться до 200 м и выдерживает давление в 21 атмосферу. В природе она бывает порой под водой больше часа — этого ей достаточно, чтобы добыть пищу или уйти от опасности.

Обитает в озере Байкал. В июне на берегах Ушканьих островов можно наблюдать большое количество этих животных — острова являются их естественным лежбищем. Эти животные любопытны и иногда подплывают к дрейфующим судам с заглушённым двигателем, длительное время находятся рядом, постоянно выныривая из воды.

Питанием нерпе служит непромысловая рыба (голомянка, байкальский бычок). За год взрослая нерпа съедает до 1 тонны рыбы. Основная пища нерпы — голомянко-бычковые рыбы. 

К 3-4 году жизни нерпы становятся половозрелыми, потомство приносят в возрасте 4-7 лет. Самцы достигают половой зрелости на год-два позже. Беременность длится 11 месяцев. 

За жизнь самка может принести, вероятно, до двадцати и более детёнышей, если учесть, что рожать она способна до 40-летнего возраста. Щенятся самки обычно ежегодно. 

Детёнышей нерпы рождают в специально подготовленном снежном логове, обычно одного, редко двух, в феврале-марте. Вес новорождённого — до 4 кг. Шкурка детёныша белого цвета. Отсюда его название — белёк. Около 4-6 недель нерпёнок проводит исключительно внутри логова, питаясь молоком матери. Пока детёныш кормится молоком матери, в воду не ныряет. 

К тому времени, как логово разрушится, он успевает практически полностью полинять. Мать проявляет заботу о малыше, отлучаясь лишь на время охоты. В присутствии матери температура внутри логова достигает +5 °C, в то время как снаружи стоят морозы −15…−20 °C.

Период лактации заканчивается через 2-2,5 месяца. Иногда лактация длится 3-3,5 месяца — наблюдается зависимость от состояния ледового покрова. С переходом на самостоятельное питание рыбой нерпята линяют, мех постепенно изменяет цвет на серебристо-серый у 2-3-месячных, а затем и на буро-коричневый — у более старших и взрослых особей.

Нерпа зимует на льду в логовищах под снегом на торосистых участках Байкала, часто в нагромождениях льдин, образующих навесы. Животное по мере образования льда на поверхности озера создаёт основной про́дух диаметром 1-2 м, поддерживая его в таком состоянии, удаляя наледи.

Когда озеро скованно льдом, нерпа может дышать только через запасные отдушины-продухи, которые делает, разгребая снизу лёд когтями передних конечностей. Вокруг её логовища до десятка и более вспомогательных продухов, отстоящих от основного на десятки и даже сотни метров. 

Продухи обычно округлой формы, размером 10-15 см, достаточным для того, чтобы высунуть над водой нос. Отдушины значительно расширяются книзу, имея форму опрокинутой воронки.

Интересно, что способность делать продухи — это врождённый инстинкт. В экспериментальном аквариуме для отдыха нерпы на водной поверхности устанавливалась небольшая плавающая площадка из 5-сантиметрового пенопласта, а остальная часть аквариума — с открытой водой. 

Молодые нерпята месячного и двухмесячного возрастов проделывали отверстия в пенопласте, разгребая его когтями снизу, выставляли нос и дышали в продухи, хотя рядом была открытая вода. «Насытившись» воздухом, снова уходили под воду. Следует заметить, что нерпята были отловлены в недельном или двухнедельном возрасте, когда они ещё питались молоком матери.

По наблюдениям, нерпа спит в воде, так как находится в обездвиженном состоянии довольно долго. Вероятно, сон продолжается до тех пор, пока хватает кислорода в крови. Во время сна нерпы аквалангисты подплывали к ней вплотную, прикасались и даже переворачивали, но животное продолжало спать.

Нерпа — вершина в пищевой цепи в экосистеме Байкала. Единственный источник опасности — человек.

До сих пор среди учёных нет единой точки зрения, как это животное попало в Байкал. Большинство исследователей придерживаются точки зрения 
И. Д. Черского о том, что нерпа проникла в Байкал из Ледовитого океана через систему рек Енисей-Ангара в ледниковую эпоху, одновременно с байкальским омулем. Другие учёные не исключают возможности её проникновения по Лене, в которую, как предполагают, был сток из Байкала.

В настоящее время популяция нерпы составляет около 100 тыс. голов. Подсчёт ведут разными способами. Наиболее быстрый, но менее достоверный — визуально с самолёта, который совершает полёты по определённой сетке маршрутов. Учётчики смотрят в иллюминатор и отмечают каждое замеченное логовище или производят аэрофотоснимки маршрутов и по ним учитывают логовища. 

Затем осуществляется пересчёт количества логовищ с единицы площади на всю акваторию озера. Второй способ — закладка по Байкалу около 100 учётных площадок 1,5×1,5 км каждая. Их объезжают на мотоцикле или обходят пешком по льду и подсчитывают все логовища, которые встречаются на площадках. Затем ведётся пересчёт на всю акваторию озера. 

И, наконец, маршрутный способ. На двух или трёх мотоциклах группа учётчиков объезжает маршруты поперёк Байкала на определённом расстоянии друг от друга, достаточном для того, чтобы видеть с мотоцикла все встречающиеся логовища. В последние годы применяется наиболее точный — площадный — учёт нерпы. 

Наибольший возраст нерп в Байкале, определённый сотрудником Лимнологического института В. Д. Пастуховым, составляет 56 лет для самок и 52 года для самцов.

Основу промысла байкальской нерпы составляет ценный мех. Жир, мясо и внутренние органы животных используются ограниченно местным населением, которое считает, что они имеют целебные свойства, однако в последнее время интерес к добыче ради мяса и жира минимален. 

Зверобойный промысел идёт по преимуществу на детёнышей после первой линьки.

Наряду с узаконенной охотой по-прежнему происходит браконьерство. Особенно жестоко ведётся охота на детёнышей нерпы в возрасте до нескольких месяцев, несмотря на то, что это запрещено законом. Вопреки устойчивым утверждениям, байкальская нерпа до сих пор не внесена в основной  раздел Красной книги, и указана только в «перечне… животных, нуждающихся в особом внимании к их состоянию в природной среде».

До 1987 г. популяция нерпы была на высоком уровне и к указанному времени превзошла оптимальные значения. В результате этого чума плотоядных у нерпы в 1987—1988 гг. смогла быстро уничтожить основную часть популяции. Было принято решение о запрещении промышленной добычи с 1980 года и о внесении вида в Красную книгу. 

На данный момент численность стабильно увеличивается. К примеру, общая численность популяции байкальской нерпы в 2015 г. (128,7 тыс. голов) по сравнению с 2014 г. (114,4 тыс. голов) возросла и продолжает оставаться на высоком уровне.

Интересные факты о нерпе:

— Нерпа — единственное млекопитающее озера Байкал.

— Нерпа может приостанавливать беременность. В некоторых случаях эмбрион прекращает развиваться, но не погибает и не разрушается, а просто впадает в анабиоз, который длится до следующего брачного периода. И тогда нерпа рождает сразу двух детенышей.

— 25 мая в Иркутской области и Бурятии отмечается День Нерпёнка — детский и молодёжный экологический праздник. День нерпёнка включен в календарь экологических дат не только в Иркутской области, но и во всей России.