Как считают некоторые специалисты - "шифрование протокола BitTorrent не позволяет скрыть содержимое торрентов. Оно создано совершенно для других целей, а именно чтобы спрятать характерные BitTorrent-заголовки в пакетах и скрыть сам факт передачи трафика по торрентам. Спрятать от операторов связи, которые примерно два года назад начали незаконно блокировать и «подрезать» трафик из торрент-сетей".
Другие специалисты считают, что включение функции шифрования не только позволяет пресечь незаконное ограничение скорости операторами связи, но и скрыть от них сам факт скачивания и раздачи каких-либо файлов.

По моему мнению, полностью скрыть факт обмена данными не представляется возможным, однако значительно затруднить идентификацию файлов шифрование может.

Приведённый ниже пример шифрования в программе µTorrent применим и для других программ, использующих протокол BitTorrent.

Итак, как же зашифровать трафик µTorrent-клиента. В программе необходимо зайти в настройки, пункт BitTorrent, затем в соответствии с рисунком и описанием выбрать один из трёх вариантов.
По умолчанию шифрование в программе отключено. После изменения и сохранения настроек желательно перезагрузить программу, т.е. выйти из неё и снова запустить.
Следует учитывать, что в некоторых случаях применение шифрования в двух вариантах увеличивает нагрузку на операционную систему.

Шифрование протокола (Protocol Encryption, PE) – это спецификация, выработанная совместно для Azureus и µTorrent. Ее назначение – обход блокирования или замедления BitTorrent-трафика интернет-провайдерами.