Весьма небольшой процент пользователей telegram когда либо пользовались секретными чатами.

Все остальные не имеют сквозного шифрования - только клиент сервер.
В том же ВоттсАппе шифруется 100% переписки алгоритмом Signal, имеющим гораздо более высокую криптографическую стойкость чем самописный (причем написанный математиками а не криптографами) MT Proto.
Но ни у кого вопросов к WA нет.
В общем все предпринятые меры (включая пакет законов Яровой) направлены на подготовку к созданию Национального Оператора Больших Данных, для централизованной монетизации Российского сегмента Интернет - одного из последних не подконтрольных бизнесов.
Речь -про необходимость реуглирования Больших Данных и необходимость защиты персональных данных россиян, отправляемых на Запад уже ведется достаточно активно.
Помимо идеи централизованной монетизации, вторым мотивом является так же правоохранительный.
В США есть дорогой и противоречивый (условно сов. секретный Prism).
В России должен быть самоокупаемый и публичный НОБД.