Варган был массовым, народным музыкальным инструментом вплоть до начала XX века.

Однако официальные источники всегда небрежно относились к нему, в основном из-за негативного отношения церкви к этому инструменту. В частности в словаре "Российской Академии Наук" этот инструмент называется просто: "Простонародное музыкальное орудие ... зубанка". “В России ...варган составляет забаву почти каждого простолюдина" (В. Одоевский). “Ваша молода княгиня ночесь всю не спала, со варганом проплясала" (Песня о князе Михаиле). “На словах, как на варганах",- поговаривали в Курской области и т.д.
Начиная с 2006 по 2008 года Б.Е.Янишевский возглавлял археологическую экспедицию в Можайске, где и были найдены два варгана XVI века. Так же удалось найти информацию о нахождении варганов в Ярославской (XII век) и Псковской области (XV век). Все имеющиеся на данный момент исторические источники о варгане позиционировали его как русский народный инструмент, однако современные учёные не обращая внимание на данные факты упорно продолжают открещиваться от многовековой русской традиции игры на варгане. По данным фольклёра, на варганах играли и девушки. А так же варган считался так же атрибутом шаманов и волхвов, таким же как и бубен.