Это был не просто храм, а памятник доблести военнослужащих. В интерьеры были вписаны мраморные мемориальные плиты: белые — с именами священников, погибших на военных кораблях, а чёрные — с именами моряков.

После революции службы в этих стенах проводились ещё в течение десяти лет, но в 1929 году собор закрыли. Позже здание перестроили и переоборудовали под общественное пространство: здесь показывали кино, проводили дискотеки и давали концерты.

Здание вернули церкви в 2002 году. Первую службу здесь провели спустя три года, но вскоре церковь закрыли на реставрацию. В 2012 году обновлённый Никольский собор освятил патриарх Кирилл. С этого момента он открыт для прихожан и считается главным морским храмом страны.

В соборе хранится несколько православных святынь. Самые почитаемые из них — мощи Николая Чудотворца, а также икона с его изображением.

В храме можно приложиться к мощам преподобного Сергия Радонежского,

канонизированного адмирала Фёдора Ушакова,

Здесь также находится икона с изображением святого Иоанна Кронштадтского.

Сейчас богослужения в храме проводятся ежедневно и побывать здесь может каждый желающий.