Иоанн Кронштадтский родился 19 октября 1829 года в селе Сура Пинежского уезда Архангельской губернии. Родители — Илья Михайлович и Феодора Власьевна Сергиевы, люди бедные, но глубоко верующие. С детства Иоанн отличался слабым здоровьем, часто болел. Однажды ночью, проснувшись, он увидел, что комнату осиял небесный свет, а посреди этого света — Ангел в небесной славе. Это видение смутило мальчика, но Ангел успокоил его, сказав, что он — его Ангел-хранитель.
В 10 лет Иоанн поступил в Архангельское приходское училище. Поначалу обучение давалось тяжело, но однажды после молитвы перед сном Иоанн почувствовал, что «завеса спала с его глаз» — он стал лучше понимать учение.
В 1851 году Иоанн окончил Архангельскую духовную семинарию и поступил в Санкт-Петербургскую духовную академию. В 1855 году он окончил академию со степенью кандидата богословия.

После рукоположения Иоанн стал священником Андреевского собора в Кронштадте. С первого дня служения он всецело отдал себя Господу и людям, стал ежедневно совершать Божественную Литургию.

Он создал один из первых в России «Дом трудолюбия» для нуждающихся, где нищие могли получить кров, работу и медицинскую помощь.
В 1857–1862 годах Иоанн преподавал Закон Божий в Кронштадтском уездном реальном училище, с 1862 года — в Кронштадтской классической гимназии.
Иоанн был мастером устного слова, его речи стенографировались и расходились в народе.

По молитвам Иоанна Кронштадтского совершались чудеса: исцелялись тяжкие болезни, прозревали слепые.
Также святой предсказывал будущее для России, например, о падении монархии, разрушении храмов, революционных бурях. Однако пророчества не ограничивались описанием бедствий — Иоанн подчёркивал, что после тяжёлых испытаний обязательно наступит время духовного возрождения.

В последние годы жизни Иоанн Кронштадтский страдал от болезни, которую кротко и терпеливо переносил, никому не жалуясь. 10 декабря 1908 года он в последний раз совершил Божественную литургию в Кронштадтском Андреевском соборе.
Иоанн Кронштадтский скончался 20 декабря 1908 года (2 января 1909) на 80-м году жизни. Он заранее предсказал день своей кончины.
Погребён в основанном им Иоанновском монастыре на Карповке (Санкт-Петербург).