Многие пользователи делят жесткий диск на несколько логических разделов.

Это нормально для структурирования данных. Например, системный диск будет C, диск D предназначен для текущей работы, а на диске E хранится фото-видео архив. Но есть нюанс — логическое разделение дисков не поможет вам, в случае форс мажорных обстоятельств.
Если жесткий диск окажется поврежден, то будут потеряны все логические разделы вместе с файлами. Не стоит использовать логические диски для хранения резервных копий. Для этого лучше подключить дополнительный физический накопитель. Риск, что оба диска сразу выйдут из строя, буквально равен нулю, на практике такое может встретиться если сам ПК будет полностью поврежден.
Более продвинутые пользователи для резервных копий используют внешние накопители, которые соединены в RAID массив. Если выходит из строя один диск, то информация всегда останется на втором. В домашних условиях самым простым способом RAID можно получить путем использования DAS (cwAVfGjNs-attached storage) устройства.
А где вы храните резервные копии файлов? Напишите в комментариях. Ответ «на флешке» — не принимается. Самый ненадежный накопитель.