Согласно вексиллологической трактовке, жёлтая полоса символизирует золото и другие природные ресурсы, синяя — море и небо, красная — кровь.
На овальном щите изображен вулкан Чимборасо и река Гуаяс, начинающаяся у его подножья. Эта картина означает красоту и богатство регионов Сьерра и Коста. Корабль на реке называется тоже Гуаяс. Он был построен в 1841 в Гуаякиле и был первым пароходом, построенным на западном берегу Южной Америки. Вместо мачты изображен кадуцей, представляющий торговлю и экономику. Наверху находится золотое солнце, окруженное астрологическими знаками Овна, Тельца, Близнецов и Рака, представляющие месяца с марта по июль, что означает продолжительность мартовской революции 1845. Кондор с распростертыми крыльями на верху щита означает мощь, величие и силу Эквадора. По бокам щита расположены 4 флага Эквадора. Лавр слева означает славу республики. Пальмовый лист справа означает мир. Фасции под щитом означают достоинство республики.

Нынешняя версия флага считается десятой по счёту — в ноябре 2009 года были утверждены новые пропорции.
Исторические флаги
11 октября 1820 — 25 мая 1822

2 июня 1822 — 31 июля 1822 
Флаг Эквадора в составе Великой Колумбии 22 сентября 1830 — 6 марта 1845

Флаг Эквадора в составе Великой Колумбии 1830—1835

Флаг Эквадора 1835—1845

6 марта 1845 — 6 ноября 1845

Флаг Эквадора 1845—1860

Флаг Эквадора 1860—1900

Флаг Эквадора 1900—2009