Храм построен на месте, где в марте 1881 года был смертельно ранен император Александр ll поэтому внутри можно увидеть место, где было совершено убийство. Сохранены булыжники мостовой, где пролилась царская кровь и часть решетки Екатерининского ( Грибоедовского) канала.

Храм был возводен по проекту архитектора Альфреда Парланда и архимандрита Игнатия в традициях древнерусского зодчества. Создатели отказались от традиционной хромовой росписи, учитывая, что в условиях холодной сырости она быстро разрушается. Весь храм украшен мозаичными композициями.

Строительство храма длилось 24 года. Площадь внешних мозаичных композиций составляет 400 кв. м, а внутренних 7065 кв. м. Над их эскизами работали такие известные художники, как Васнецов, Нестеров, Рябушкин, Беляев.

Он трижды мог быть разрушен и чудом уцелел.

В октябре 1930 года храм был закрыт и было принято решение снести здание, но точные сроки не были обозначены и храм остался стоять до начала Великой Отечественной войны.

В 1956 году было принято решение снести храм, местоположение которого мешало плану строительства новых дорог в северной столице. На его защиту встали руководители многих музеев страны, историки и искусствоведы.

В 1961 году в храме был расположен склад декораций Малого театра оперы и балета имени Мусоргского. В какой то момент на складе возник пожар, который нанес значительный урон внутреннему убранству собора, повредив уникальную мозаику. При осмотре здания после пожара, верхолазами был обнаружен неразорвавшийся немецкий фугас. 150 ти килограммовый снаряд пробил кровлю и, застряв в перекрытии, пролежал под куполом целых 20 лет чудом не разорвавшись. Храм был закрыт на реставрацию, которая продолжалась 27 лет.

Убранство собора восхищает воображение - 7000 кв метров необыкновенной красоты композиций из мозайки, выложенной человеческими руками! Это ли не чудо?!