Прообраз фломастера существовал в древнем Египте.

В 1922 году на западном побережье Нила при раскопках в гробнице Тутанхамона египтологи обнаружили медный карандаш со свинцовой трубочкой. В ней находилась тростинка, пропитанная чернилами.
В 1910 году Ли Ньюман запатентовал первый войлочный маркер, заполненный чернилами. Эти маркеры стали популярны, после появления на рынке ручки Magic Marker в середине пятидесятых годов, которая состояла из стеклянной трубки с чернилами. С этого момента, войлочными маркерами пользуются все. Производили эти маркеры в торговой компании Flo-Master. От названия этой фирмы и произошло слово фломастер.
B 1942 сотрудник токийской фирмы «Tokyo Stationery Company» представил изобретение с похожим наконечником для равномерного вытекания чернил. Поначалу новинку запретили, поскольку краска содержала опасный для детей свинец. На доработку ушло почти 20 лет. 17 марта 1960 первые безопасные фломастеры поступили в продажу. Затем идею у японцев выкупила немецкая фирма «Edding». Она заменила наконечник маркера на прессованный войлок и первой стала продавать фломастеры в Европе. Под этим названием выпускались чернила, широко используемые в то время практически во всех фломастерах.
В конце 1970 года фломастеры начали использоваться во всех школах изобразительного искусства. С 1980 года фломастеры были окончательно признанными. Китайские фирмы начали активно выпускать самые разнообразные наборы, в которых насчитывалось около 70 ярких цветов.
В семидесятые фломастеры добрались до СССР. Их поставляли чехословацкие фирмы в картонных упаковках по шесть цветов. Долгое время советские художественные школы и училища фломастеры не признавали и запрещали к использованию. По мнению педагогов, так ученик не мог передавать полутона. Дети же от фломастеров были в восторге. B отличие от Запада, у нас высохший маркер не выбрасывали. Новый-то купить было сложно. Ему продлевали жизнь. Внутрь стрежня заливалось немного спирта, одеколона или водки. Это растворяло чернила внутри и фломастер ещё какое-то время мог рисовать.
Простейший фломастер представляет собой пластиковый корпус и фетровый наконечник. Внутри корпуса находится пропитанный красящим веществом пористый стрежень. По мере расходования количество краски в стержне уменьшается. Однако фетровый наконечник позволяет использовать абсолютно всю краску без остатка. Сегодня чернила обычно изготавливают на основе спиртов, фломастеры могут быть водонепроницаемыми, сухими или постоянными,
В наши дни продаётся огромное количество фломастеров. В канцелярском магазине запросто можно найти упаковку на 72 цвета. Размеры бывают стандартными, а могут быть гигантскими. Кроме того, есть маркеры для оформления плакатов, маркировки товаров или с эффектами акварели, которые применяют художники для создания картин. Есть «магические» фломастеры, которые меняют цвет в процессе рисования. Самый технологичный на сегодняшний день маркер специально разработан NASA для работы космонавтов на орбите. Он может писать при нулевой гравитации, при больших перепадах температур, на скользком металле, пластике и влажной бумаге.