Средства на строительство храма жертвовали проживавшие в городе греки. Наиболее значительное пожертвование сделал владелец табачной фабрики Ахиллес Асланиди. Храм был заложен в 1907 году, и в 1909 году строительство было завершено.
Рядом с ней были построены здания Эллинского благотворительного общества и двухэтажное здание греческой школы.
Автором проекта храма был архитектор И. П. Злобин. Строительство осуществлялось под руководством городского архитектора Г. Н. Васильева. Внутренние росписи храма выполнил художник Е. Г. Черепахин. Храм был построен в стиле неоклассицизма. Его размеры составляли 19×10 саженей (40,5×21 м). Над главным входом с четырёхколонным портиком возвышалась двадцатиметровая двухярусная колокольня. При храме действовала библиотека с книгами на греческом языке. В 1913—1914 годах настоятелем храма был священник Парисис Савва.
Дата снимка неизвестна

Снимок 1950-1960-х годов. Справа от церкви двухэтажное здание школы № 7, ныне - Загс Кировского района.

В 1930-х годах храм был закрыт и приспособлен под детскую техническую станцию. Во время немецкой оккупации Ростова храм вновь открыли.
6 ноября 1942 года около Благовещенской церкви проходил смотр-парад румынских войск, посвящённый дню рождения румынского короля Михая I. На мероприятии присутствовали немецкие офицеры. Парад завершился торжественным богослужением в Благовещенской церкви.

В 1959 году храм закрыли окончательно. Здание было передано соседней школе школы № 7. В бывшей церкви разместился спортзал и учебно-производственные мастерские. На момент ликвидации храм был одним из крупнейших в городе, в будние дни на службу приходило по 30 человек, по воскресеньям же он был полностью заполнен людьми, что вызывало раздражение властей, проводивших антицерковную политику. Ещё ранее церковь была обнесена трёхметровым забором, но эта мера не привела к сокращению числа прихожан. В 1964 году храм был перестроен в Театр кукол (Университетский переулок, 46). В Донской митрополии утверждают, что осталось полноценное храмовое здание, в котором снесли купол, убрали входные портики и пристроили новый современный вход.