Стандартом считается добавить сайт в Яндекс и гугл вебмастер, потому что они дают 90-95% трафика, да и в целом этого достаточно, чтобы контролировать здоровье сайта.

Однако я всегда добавляю еще и mail и bing. Во первых мне интересны эти инструменты и их развитие. Во вторых в bing можно по запросу просканировать сайт и получить список проблем. Яндекс и Гугл такого не позволят.
В бинг, кстати, можно бесплатно смотреть ссылки конкурентов.
А в мэйл есть показатели привлекательности документа и удовлетворённости пользователя.