Вопрос:

ООО получило первый займ от физлица в одном периоде. Второй займ выдало этому же физлицу. Стороны договорились провести взаимозачет займов.
Ответ:
ККТ не нужна, поскольку в Законе № 54-ФЗ речь идет про займы, выданные на покупку товара, работы или услуги. А в вашем случае речь про займ иного вида.