Основной сценарий игры носит название «Письмо из Тихого Рая» (англ.

Letter from Silent Heaven). Главный герой Silent Hill 2, Джеймс Сандерленд, получает письмо от своей жены Мэри, которая умерла от болезни три года назад[38][39]. Мэри приглашает Джеймса приехать в небольшой курортный городок Сайлент Хилл, где они когда-то хорошо провели время. Она пишет: В своих беспокойных снах, я вижу этот город. Сайлент Хилл. Ты обещал, что когда-нибудь отвезёшь меня туда. Но не сдержал обещания. Ну, сейчас я там одна... Жду тебя в нашем «особом месте»...
[показать]
Оригинальный текст (англ.) [показать]
Осматривая заброшенный туманный город, на кладбище он встречает девушку Анжелу[40]. Протагонист говорит, что заблудился и ищет дорогу. Указав правильный путь, она советует главному герою держаться от этого места подальше, утверждая, что с этим городом что-то не так. По пути Сандерленд видит Лежачую фигуру, которую убивает деревянной доской. Он находит приёмник, в которым слышны обрывки фраз, и забирает его с собой. Блуждая по жилому дому Лесная Долина (англ. Wood Side Apartment), Джеймс встречает маленькую девочку Лору, которая всячески ему мешает. Войдя в одну из комнат, он обнаруживает Пирамидоголового, который насилует двух Манекенов. Испугавшись, протагонист прячется в шкафу. Джеймс делает несколько выстрелов из пистолета, заставляя монстра отступить. В другом помещении Сандерленд находит труп и знакомится с полным парнем Эдди, который утверждает, что он никого не убивал[40].
В парке Роузуотер (англ. Rosewater Park) Джеймс видит Марию, которая внешне очень походит на его покойную жену[41]. Поняв, что обознался, главный герой хочет уйти, но Мария, упоминая что повсюду разгуливают монстры, просит взять её с собой. Узнав, что Лора что-то знает о Мэри, он преследует её и направляется в госпиталь Брукхэвен (англ. Brookhaven Hospital). Попав в альтернативную версию здания, Джеймс убегает с Марией от Пирамидоголового. Он забегает в лифт, в то время как его спутница не успевает этого сделать. Монстр убивает Марию[42].
Главный герой возобновляет свои поиски и отправляется в Историческое общество Сайлент Хилла (англ. Silent Hill Historical Society). Он обнаруживает там Эдди, сидящего с пистолетом напротив мёртвого тела[К 3][43]. Домбровски заявляет, что легко убил человека, который насмехался над его весом, однако сведя всё в шутку, он уходит. В Лабиринте протагонист находит Марию, живую и невредимую, в запертой комнате[40][44]. Мария рассказывает о днях, проведённых с Мэри в отеле, и заявляет, что она будет той, кем захочет видеть её Джеймс[45]. Сандерленд уходит, обещая найти путь к ней. По дороге он слышит крики Анжелы и спасает её от Абстрактного Папочки. Она признаётся, что подверглась сексуальному насилию со стороны своего отца[46]. Из газетной вырезки становится понятно, что Анжела убила его до того, как отправилась в Сайлент Хилл[47]. Джеймс достигает другой стороны клетки, однако обнаруживает мёртвое тело Марии, лежащее на кровати.