Содержат японских карликовых мышей в террариумах либо в клетках размером не меньше чем 40 на 30 см. Если использовать клетку, то расстояние между прутьями должно быть не больше 5 мм. Не рекомендуется ставить клетку возле аппаратуры, батарей и занавесок. Противопоказаны сквозняки и прямые солнечные лучи. Комфортная температура для мышей, живущих в помещении 20-22 градусов. Для содержания этих животных требуются: кормушка, поилка, домик и колесо. Для подстилки можно использовать опилки или специальные наполнители. Чистить клетку необходимо 1-2 раза в неделю.

Основой полноценного питания являются специализированные зерновые смеси, в состав которых входит овёс, пшеница, просо, кукуруза и прочие компоненты. В среднем японская мышка съедает около чайной ложки корма в сутки. В рацион мышей можно включать фрукты и овощи. Например: яблоки, морковь, огурцы и другие. А так же травы, такие как одуванчик, подорожник и листья салата. Запрещается давать мышам цитрусовые, солёное, острое, сладкое, жирное и консервированное. Кормить животных нужно один раз в день. Обязательно в поилке должен быть запас свежей воды.

Рекомендуется сразу заводить два зверька, поскольку мыши любят общение. Лучше всего если это будут две самки т. к. они лучше уживаются вместе и не приносят потомство. Это и есть основные правила содержания декоративных мышей.