КНУ имени Ж.Баласагына Три государственных университета реорганизовали путем присоединения к Кыргызскому национальному университету. Соответствующий указ подписал президент Садыр Жапаров. Так, реорганизованы Нарынский государственный университет, Таласский государственный университет и Баткенский государственный университет. Кабинету министров поручено привести в соответствие свои решения согласно указу. Кыргызский национальный университет имени Жусупа Баласагына основан в 1925 году. Он является государственным учреждением, которое предлагает программы бакалавриата, магистратуры и специалитета по более чем 75 направлениям.    Нарынский государственный университет был основан в 1996 году на базе четырех учебных заведений: Сельскохозяйственного техникума, Педагогического колледжа, Института повышения квалификации учителей и филиала Кыргызского архитектурно-строительного института.

Таласский госуниверситет был основан в 1994 году на базе педагогического училища, действовавшего еще с 1930-х годов.

Баткенский государственный университет (БатГУ) был создан в 1999 году.