В рамках "микологии" изучают систематику грибов, распространение грибов в природе, экологию, морфологию и ультра структуру, физиологию, генетические и биохимические свойства, прикладные аспекты.

ПРИМЕНЕНИЕ  ГРИБОВ ЧЕЛОВЕКОМ:
- В качестве еды (съедобные грибы, в производстве сыра, вина, пива).
- Для переработки отходов.
-В биотехнологии продуктов, в т.ч. лекарств (например, пенициллина), иммуномодулирующих полисахаридов.
- Грибы как патогены вредителей растений.
- В качестве лекарственных средств.
- В качестве объектов в биологических исследованиях.

ВРЕД  ГРИБОВ:
- Контаминация и порча пищевых продуктов.
- Разрушение деревянных, текстильных и др. изделий.
- Возбудители болезней растений.
- Микотоксикозы (токсины грибов - микотоксины).
- Мицетизм (отравления грибами и продуктами их жизнедеятельности).
- Ммикогенные аллергии (вызываемые грибами).
- Микозы (заболевания человека и животных, вызываемые грибами).

Историю микологии условно разделяют на несколько периодов, которые приблизительно соответствуют этапам развития биологических наук в целом. Л. И. Курсанов в 1940 году выделил три основных периода. Первый, или старый период, согласно Курсанову, длился от древности до середины XIX века, он характеризуется как начальное освоение разнообразия форм грибов, понимаемых как готовые неизменные единицы. Этот период завершился появлением работ Х. Персона и Э. Фриса, в которых была создана достаточно подробная формальная система грибов. Второй, или новый период продолжался с середины до конца XIX века. Статическое понимание грибов в этот период резко сменилось историческим, динамическим. В этот период началось изучение онтогенеза и жизненных циклов грибов, а затем и их филогенеза. Тогда же появились первые работы по паразитным грибам, и было положено начало научной фитопатологии. Основоположниками второго периода считаются Л. Тюлян и А. де Бари. Третий период, названный Курсановым новейшим, воспринял от предыдущего динамический подход, научная методология была дополнена введением цитологических методов, также началось широкое введение экспериментальных методов изучения половой функции, условий жизнедеятельности грибов. Отдельные исследования, описывающие цитологию грибных структур, а также явление дикариотичности, появлялись с 1860-х годов, однако массовый переход на новый уровень научных представлений произошёл на рубеже XIX и XX веков. В 1953 году Б. П. Васильков разделил историю изучения грибов в России и СССР на 4 периода:

Для 1-го, начального периода этот автор указывает временны́е границы от древности до второй четверти XVIII века, характеризуется он главным образом изучением возможности употребления грибов в пищу, в качестве лекарственных средств и выработкой методов заготовки и переработки грибов, основные принципы которых применяются и теперь. 

2-й период Васильков назвал Флористическим, он длился до середины XIX века. В этот период проводились многочисленные экспедиции с целью учёта разнообразных видов полезных растений, в т.ч. и грибов. Особую важность эти экспедиции имели для России с её огромными и малоисследованными ещё территориями и древними традициями употребления грибов. 

3-й период, примерно соответствующий второму периоду Курсанова, длился с 1860-х по 1920-е годы и был назван Васильковым Онтогенетическим. 

4-й, Современный период Васильков характеризует как такой, в котором было сознательно произведено объединение "чистой" науки с практикой, искусственно отделённых друг от друга в Онтогенетический период.

Рисунок выше - /Теофраст (ок. 370 - между 288 и 285 до н. э.). Теофраст, или Феофраст (др.-греч. Θεόφραστος Ἐρέσιος, лат. Theophrastus Eresius; ок. 370 до н. э., г. Эрес, остров Лесбос - между 288 до н. э. и 285 до н. э., Афины) - древнегреческий философ, естествоиспытатель, теоретик музыки. Разносторонний учёный; является наряду с Аристотелем основателем ботаники и географии растений. Благодаря исторической части своего учения о природе выступает как родоначальник истории философии (особенно психологии и теории познания). Родился в семье сукновала Меланта на Лесбосе. При рождении имел имя Тиртам. Теофрастом ("богоречивым") его прозвали впоследствии. Учился в Афинах у Платона, а затем у Аристотеля и сделался его ближайшим другом, а в 323 году до н. э. - преемником на посту главы школы перипатетиков (Ликея). Среди его учеников были комедиограф Менандр, учредитель Александрийского мусейона Деметрий Фалерский и преемник на посту главы Ликея Стратон. Теофраста принимал македонский царь Кассандр. Прожил 85 лет и погребён с почестями в Афинах. Теофраста называют "отцом ботаники". Ботанические труды Теофраста можно рассматривать как свод в единую систему познаний практиков сельского хозяйства, медицины и работ учёных античного мира в этой области. Теофраст был основателем ботаники как самостоятельной науки: наряду с описанием применения растений в хозяйстве и медицине он рассматривал теоретические вопросы. Влияние трудов Теофраста на последующее развитие ботаники в течение многих столетий было огромным, так как учёные Древнего мира не поднимались выше него ни в понимании природы растений, ни в описаниях их форм. В соответствии с современным ему уровнем знаний отдельные положения Теофраста были наивны и не научны. Учёные того времени ещё не имели высокой техники исследования, не было и научных экспериментов. Но при всём этом уровень знаний, достигнутый "отцом ботаники", был весьма значительным. Написал 2-е книги о растениях: "Historia plantarum" (др.-греч. Περὶ φυτῶν ἱστορίας, "История растений") и "De causis plantarum"[fr] (др.-греч. Περὶ φυτῶν αἰτιῶν, "Причины растений"), в которых даются основы классификации и физиологии растений, описано около 500-т видов растений, и которые подвергались многим комментариям и часто переиздавались. Несмотря на то, что Теофраст в своих "ботанических" трудах не придерживается никаких особенных методов, он внёс в изучение растений идеи, совершенно свободные от предрассудков того времени и предполагал, как истинный натуралист, что природа действует сообразно своим собственным предначертаниям, а не с целью быть полезной человеку. Он наметил с прозорливостью главнейшие проблемы научной растительной физиологии. Чем отличаются растения от животных? Какие органы существуют у растений? В чём состоит деятельность корня, стебля, листьев, плодов? Почему растения заболевают? Какое влияние оказывают на растительный мир тепло и холод, влажность и сухость, почва и климат? Может ли растение возникать само собой (произвольно зарождаться)? Может ли один вид растений переходить в другой? Вот вопросы, которые интересовали ум Теофраста; по большей части это те же вопросы, которые и теперь ещё интересуют натуралистов. В самой постановке их - громадная заслуга греческого ботаника. Что же касается ответов, то их в тот период времени, при отсутствии нужного фактического материала, нельзя было дать с надлежащей точностью и научностью. Наряду с наблюдениями общего характера "История растений" содержит рекомендации по практическому применению растений. В частности, Теофраст точно описывает технологию выращивания специального вида тростника и изготовления из него тростей для авлоса... Наибольшей известностью пользуется его сочинение "Этические характеры" (др.-греч. Ἠθικοὶ χαρακτῆρες; русский перевод "О свойствах нравов человеческих", 1772, или "Характеристики", СПб., 1888), сборник из 30 очерков человеческих типов, где изображаются льстец, болтун, бахвал, гордец, брюзга, недоверчивый и т. д., причём каждый мастерски обрисован яркими ситуациями, в которых этот тип проявляется. Так, когда начинается сбор пожертвований, скупой, не говоря ни слова, покидает заседание. Будучи капитаном корабля, он укладывается спать на матрасе кормчего, а на праздник Муз (когда принято было посылать учителю вознаграждение) оставляет детей дома. Нередко говорят о взаимном влиянии Характеров Теофраста и персонажей новой греческой комедии. Несомненно его влияние на всю новейшую литературу. Именно начав с переводов Теофраста, создал свои "Характеры, или Нравы нашего века" (1688) французский писатель-моралист Лабрюйер. С Теофраста берёт начало литературный портрет, неотъемлемая часть любого европейского романа. Из 2-х  томного трактата "О музыке" сохранился ценный фрагмент (включён Порфирием в его комментарий к "Гармонике" Птолемея), в котором философ, с 1-й стороны, полемизирует с пифагорейско-платоновским представлением музыки как очередной - звучащей - "инкарнации" чисел. С другой стороны, он считает мало существенным и тезис гармоников (а возможно, и Аристоксена), рассматривавших мелодию как последовательность дискретных величин - интервалов (промежутков между высотами). Природа музыки, заключает Теофраст, не в интервальном движении и не в числах, а в:

- "Движении души, которая избавляется от зла через переживание (др.-греч. διὰ τὰ πάθη). Не будь этого движения, не было бы и сущности музыки".

Теофрасту также принадлежит (не дошедшее до нас) сочинение "О слоге" (или "О стиле"; Περὶ λέξεως), которое, как считает М.Л.Гаспаров, по своему значению для всей античной теории ораторского искусства стоит едва ли не выше "Риторики" Аристотеля. Его неоднократно упоминают Дионисий Галикарнасский, Деметрий Фалерский и др./.

Считается, что первое упоминание грибов в научной литературе принадлежит Аристотелю, ученик Аристотеля Теофраст, называемый "отцом ботаники", вероятно, первым из античных мыслителей попытался систематизировать знания о грибах, известных в древности. Он упоминает сморчки, трюфели и шампиньоны, которые называет μύκης, от этого слова позднее произошло одно из научных названий грибов - лат. mycetes, и название науки микологии. Кроме того, в его трудах под общим названием έρυσιβη (erysibe) описаны болезни растений - мучнистая роса и ржавчина (позже возбудитель 1-й стали называть по-латыни Erysiphe). Происхождение этих болезней античные учёные, конечно, ещё не могли связать с грибами, а объясняли влиянием избыточной влажности (до сих пор по поводу влажности сохраняются суеверия у садоводов-огородников). Около 150 года до н.э. поэт, грамматик и врач Никандр Колофонский впервые разделил "грибы" на "съедобные" и "ядовитые" - это считается началом "классификации грибов".

Рисунок выше - /Педаний Диоскорид (ок. 40 - ок. 90 н. э.). Педа́ний Диоскори́д (Педа́ний Диоскури́д) (греч. Πεδάνιος Διοσκορίδης, лат. Pedanius Dioscurides; родился около 40 года, Аназарб, Малая Азия, Римская империя - умер около 90 года, провинция Киликия, Римская империя) - древнегреческий военный врач, фармаколог и натуралист. Считается 1-м из "отцов ботаники и фармакогнозии". Автор работы Περὶ ὕλης ἰατρικῆς ("О лекарственных веществах"), более известной в Западной Европе под латинским названием "De materia medica" - 1-го из самых полных и значительных собраний рецептов лекарственных препаратов, дошедших до наших дней. Грек по происхождению, Диоскорид много странствовал вместе с римской армией при императоре Нероне, занимаясь военной медициной, коллекционированием и определением растений и других медицинских веществ различного происхождения. Исследователи Даниэль Леклерк, Иоганн Альберт Фабрициус и Курт Шпренгель уверены, что работа "О лекарственных веществах" (др.-греч. Περὶ ὕλης ἰατρικῆς, лат. De materia medica) была закончена в 77-78 годах н.э. В её основу были положены рецепты из ещё более древних собраний греческого врача и фармаколога Кратеуаса, который был личным врачом понтийского царя Митридата VI Евпатора около 100 года до н.э. Работа содержит описания более 1000 различных медицинских препаратов, в т.ч. 813 растительного, 101 животного и 102 минерального происхождения, и состоит из 5-ти книг:
- Специи, масла, мази и деревья, а также соки, смолы и фрукты.
- Животные, мёд, молоко, жиры, зёрна и овощи.
- Корни, соки, травы и семена.
-  Остальные травы и корни.
-Вина и металлы.
Автор сгруппировал описания по морфологическим признакам. Для многих веществ указал места распространения и нахождения, привёл синонимы на разных языках, изложил способы добывания и приготовления лекарственных средств, привёл сведения о ряде химических процессов. До открытия Нового Света, а с ним и новых растений и других видов фармакологических веществ, "De materia medica" считалась основным и полным источником по ботанике и фармакологии. Описания Диоскорида, в отличие от описаний Плиния Старшего, свободны от грубых ошибок, предрассудков и магических толкований. Многие из названий растений, которые используются сегодня, были взяты Карлом Линнеем из произведений Диоскорида. Диоскоридом впервые описано важнейшее практическое достижение греко-египетских алхимиков - явление амальгамирования металлов. Фармакологические рецепты Диоскорида упоминаются в трудах Галена, Авиценны и всех врачей Средневековья. Дословное воспроизведение некоторых записей Диоскорида у Плиния, возможно, указывает на использование 1-х и тех же источников. Допетровская Русь познакомилась с полными трудами Диоскорида в XVII веке.

Рисунки выше - /Страницы из "Венского Диоскорида" с описанием и иллюстрациями подорожника азиатского (Plantago asiatica), гадючьего лука хохлатого (Muscari comosum) и сойки (Garrulus glandarius)/.

В отличие от многих античных авторов, труды Диоскорида не нуждались в повторном "открытии" в эпоху Ренессанса, поскольку никогда не исчезали из круга профессионального интереса. На протяжении 1500 лет они неоднократно переписывались с добавлением иллюстраций, комментариев, вставок из арабских и индийских источников. Многие из таких манускриптов, самые ранние из которых относятся к V-VII векам нашей эры, сохранились до наших дней. Самый известный из них - Венский Диоскорид (создан в начале VI века для Аникии Юлианы), хранящийся в Австрийской национальной библиотеке. Благодаря 435 тщательно выполненным рисункам растений и животных Венский Диоскорид представляет не только научный, но и художественный памятник, образец византийского стиля/.

В древнем Риме также делались описания некоторых грибов. Диоскорид посвятил грибам 2-е главы своего сочинения "De materia medica". Кроме описаний "съедобных" и "ядовитых" грибов, он описывал медицинское применение трутовика лиственничного под названием agaricus, с тех пор это название сохранилось в фармакопее (агарик аптечный, лат. agaricus officinalis). Среди грибов Диоскорид выделял "наземные", "подземные" и "растущие на деревьях", такую классификацию можно назвать "делением на экологические группы". Плиний Старший рассматривал грибы в качестве отдельной группы fungi, как и Никандр, он классифицировал их на "съедобные" (fungi esculenti) и "ядовитые" (fungi noxici et perniciosi). В своей "Естественной истории" Плиний описывал "виды" пористые грибы (fungus porosus), рогатиковые грибы (fungus ramosus), иудино ухо (fungus sambuci), дождевики (fungus pulverulentus), трюфели (tubera terrae), вёшенки (pezicae Plinii), лиственничный трутовик (fungus laricis, или agaricum). Плиний указывал на обилие трутовиков на стволах деревьев и пнях в Галлии, правильно трактуя эти образования как "грибы" и отмечал, что ночью:
- "Наблюдается свечение пней с грибами".

В Римской империи, очевидно, хорошо были известны свойства некоторых грибов. Цезарский гриб, называвшийся boletus, упоминается в "Сатириконе" Петрония и "Сатирах" Ювенала (Сатира V). Предполагают, что политических противников могли устранять, подавая им блюда, приготовленные из бледной поганки вместо цезарских грибов. Согласно 1-й из версий, таким способом был отравлен император Клавдий. Античные учёные не проводили научных исследований грибов, а только кратко описывали их, главным образом как продукты питания. С падением Римской империи пришли в упадок и классические античные науки. Некоторые средневековые авторы только пересказывали античные сведения о грибах. Единственный известный оригинальный труд этой эпохи принадлежит немецкой монахине Хильдегарде Бингенской, в её рукописи "Книга о растениях" содержатся уникальные для того времени по числу и полноте описания грибов. Упоминания грибов в русских письменных документах известны с 1378 года (жалованная грамота Палеостровского монастыря), а памятник русской литературы XVI века "Домострой" содержит поучения о том, как лучше заготавливать грибы. 

Рисунок выше - /Шляпочные грибы и трутовики Иеронима Бока (1498-1554)/.

Рисунок выше - /Иеронимус Бок (нем. Hieronymus Bock), грецизированное имя - Трагус (др.-греч. τράγος, перевод с нем. Bock - "козёл") (1498 - 21 февраля 1554) - немецкий ботаник, медик и лютеранский проповедник. 1-н из "отцов ботаники". Иеронимус Бок родился в 1498 году. В 1522 году он получил должность преподавателя и ботаника в Цвайбрюккене, резиденции герцога Людвига II. 1-м из его учеников был Якоб Дитрих Мюллер, позже известный как Якоб Теодор Табернемонтанус (ок. 1522-1590), автор известного травника. В 1546 году Иеронимус Бок написал научную работу Kreuterbuch. В работе Иеронимуса Бока Kreuterbuch есть глава на 5 страницах, содержащая описания около 10 шляпочных грибов и трутовиков, описаны распространение, сезон, указывается съедобность или ядовитость и способы приготовления грибов. У Бока имеются сопоставления описаний с классическими античными трудами. Его ботанические, медицинские и фармакологические исследования составляли основу его научной деятельности и главное дело в его жизни. Умер в городе Хорнбах 21 февраля 1554 года. Шарль Плюмье назвал в его честь род растений трагия (Tragia) семейства Молочайные. Позже это название было принято Карлом Линнеем. Также Линней назвал в его честь род трагус (Tragus) семейства Злаки/.

С началом эпохи Возрождения европейскими учёными вновь стали исследоваться различные группы живых организмов, в т.ч. и грибы. Их описания и рисунки имеются в появляющихся с XVI века в Германии, Фландрии травниках. В "Травнике" (нем. Kräuterbuch) Иеронима Бока (1498-1554) имеется глава на 5 страницах, содержащая описания около 10 шляпочных грибов и трутовиков, описаны распространение, сезон, указывается "съедобность" или "ядовитость" и способы приготовления грибов. У Бока имеются сопоставления описаний с классическими античными трудами. В "Травнике" (нидерл. Cruydeboeck, или Cruijdeboeck, Cruydt-Boeck) Ремберта Додонса, который в течение 2-х столетий служил классическим справочником по ботанике, грибы составляют 1-ну из 6-ти групп растений, и классифицируются по различным признакам: форма, токсичность, сезон появления.

Рисунок выше - /П.А.Чезальпино (1519-1603). Андре́а Чезальпи́но, или Цезальпи́н (итал. Andrea Cesalpino, лат. Andreas Caesalpinus, 6 июня 1519, Ареццо, Тоскана, Италия - 23 февраля 1603, Рим, Италия), - итальянский врач, естествоиспытатель и философ. Местом его деятельности была сначала Пиза. Философия с ранних лет привлекала его. Отдавшись изучению её под руководством Аристотеля, он с первых же шагов своей самостоятельной преподавательской деятельности стал резко нападать на схоластику, господствовавшую в школьной философии того времени. Это возбудило против него вражду многих влиятельных лиц. Несмотря на наветы и даже прямые (неосновательные) обвинения в безбожии, Цезальпин не подвергся суду инквизиции и даже не был стесняем в своей преподавательской деятельности. Факт этот находит себе объяснение отчасти в самом характере его философского учения, оставлявшего место чудесам даже в естественном порядке природы, отчасти в благосклонном отношении к нему Римской курии (папа Климент VIII назначил его своим первым лейб-медиком). В Риме Цезальпин продолжал свою преподавательскую деятельность и там же умер. Преподавал в Пизанском университете (1555) и в папской Коллегии мудрости в Риме (1592). Гербарий Цезальпина сохраняется во Флоренции. Некоторые учёные считают Чезальпино первым, ещё до Гарвея, открывшим кровообращение - он описал большой круг кровообращения. Сердце он рассматривал в качестве центра движения крови и указал на центростремительный ток крови в венах. Он подробно описал клапаны сердца, малый круг кровообращения, отметил различия в структуре лёгочных артерий и вен, аналогичные различиям в структуре системных артерий и вен, но у него ещё не было ясного представления о большом круге кровообращения. Чезальпино обнаружил соединение между воротной и нижней полой венами, описал связь между расширением артерий и сокращением сердца и обратил внимание на вопрос возможного наличия сообщения между артериями и венами ("Questionum medicarum libri II", 1593). По словам одного из врагов его, идеи Цезальпина пользовались такой широкой известностью, что не только в Италии, но даже в Германии внушали к себе бо́льшее уважение, нежели изречения дельфийского Аполлона у греков. Цезальпин постоянно оставался аристотеликом или, вернее, перипатетиком, воспринявшим, однако, в своё философское учение некоторые позднейшие элементы. В истории философии установился тот взгляд, что Цезальпин преобразовал аверроистический аристотелизм в пантеизм. В этом смысле он признаётся одним из видных предшественников Спинозы. Своё философское учение он изложил в труде "Quaestiones peripateticae" (Венеция, 1571; ко 2-му изданию, 1593, присоединён другой философский трактат - "Daemonum investigatio peripatetica").

Основные положения его учения сводятся к следующему. Наше мышление отправляется от всеобщего; последнее выражается или в общих и основных принципах разума, или в общем представлении, которое слагается в нас благодаря показаниям чувств от соприкосновения с внешними предметами. Однако это всеобщее, познаваемое нами при помощи индукции, является лишь неопределённым и смутным целым, преобразующимся в отчётливое и ясное познание природы вещей лишь благодаря усмотрению различий.
Процесс определения понятий показывает нам, что такое субстанция, и приводит нас к противоположности между формой и материей вещей, а также к причине, объясняющей, почему субстанция такова, какова она есть на самом деле; но мы никогда не в силах доказать, что сущее есть на самом деле. Там, где мы не встречаем сочетания материи и формы, определение понятий не может иметь применения. Чистая форма не подлежит объяснению; она есть самое всеобщее и простое, сущее, которое не может иметь причины. Это одухотворяющее формирующее начало, этот принцип всех форм и есть Бог, первый и высший разум, а следовательно, первое, абсолютно чистое и простое действие. Эта первоначальная субстанция является источником первичной силы; она не имеет ничего общего с количеством и потому не может быть названа ни конечной, ни бесконечной; она не может быть продуктом чьего-либо творчества и не может действовать ради какой-нибудь определённой цели в собственном смысле этого слова, так как сама является конечной целью всех возможных целей, неподвижной самой в себе; она заслуживает безусловной любви. Но для того, чтобы божественное, или абсолютное, добро могло быть абсолютно желательным, должны быть ещё и такие субстанции, такие существа, который могли бы избирать его целью своих стремлений. Поэтому-то независимо от первичной субстанции есть ещё другие, существование которых сводится к ней и которые являются субстанциями лишь постольку, поскольку они сопричастны этому принципу одухотворяющей формы. В нём-то и коренится единство мировой системы.

Роды и виды существ вечны, одни лишь индивидуумы имеют преходящее бытие; несмотря на индивидуальную смерть отдельных существ, творческая сила первичной субстанции неиссякаема, творческий процесс вечен. Начало, одухотворяющее живые существа, проникает собою и всю Вселенную вплоть до её мельчайших частей; им же проникнуто и атомистическое строение косного принципа - материи. Частицы материи, наполняющие собой мироздание, квалифицируются Цезальпином различно с т.з. их совершенства.

Градация устанавливается отношением к центру материального мира - к солнцу и небу как сфере последнего. В нём источник их жизни и движения. Небесного огня или источника тепла недостаточно ещё, однако, для образования жизни, хотя, по-видимому, процессы разложения материи (например, гниение) порождают живые организмы, дотоле не существовавшие; заблуждением было бы предполагать, что одних материальных условий достаточно для такого самозарождения: без участия конечной движущей причины мира, без воздействия творческой формы никакая жизнь не мыслима.

В психологии Цезальпин является чистым спиритуалистом. Духовное начало человека резко различается им от душ других живых существ. Только человек обладает разумной, мыслящей и бессмертной душой. Действия его души не зависимы от тела; причинной связи здесь не существует. Соединяя все отдельные члены тела в гармоническое единство, душа является формой для тела. Не локализируясь ни в одной из частей последнего, она лишь проникает его собою. Если уже непременно желательно говорить о её седалище, то эта роль всего скорее может быть приписана сердцу, источнику движения и деятельности всего организма. Здесь средоточие нашей чувственности.

Чувственные образы, воспринятые нашей душой, не имеют пространственного протяжения. Познавая единое во всех вещах нашего внешнего опыта, а вечное и божественное начало - в нас самих, в недрах собственной духовной субстанции, мы приобщаемся к истинному блаженству Божества, которое, однако, лишь тогда станет нашим совершенным и неотъемлемым достоянием, когда в акте смерти наш интеллект отрешится окончательно от чисто человеческих черт своей деятельности и вступит в состояние чистого о себе бытия. Такими чертами характеризуется психология Цезальпина. Допуская чудеса, как акты специального проявления Божества в мире естественных явлений, Цезальпин решительно отвергал веру в тёмные силы природы, в магию и волшебство, столь распространённую в его время. Чезальпино открыл период искусственных систем в ботанике. В его главном сочинении 16 книг о растениях (лат. De plantis libri XVI, Флоренция, 1583), кроме описания многочисленных растений, изложена принципиально новая система, основанная на дедуктивном подходе Аристотеля - на строении семян, цветков и плодов, то есть на разбиении множества по пути от общего к частному, и на знании огромного фактического материала из области морфологии растений. Соглашаясь со взглядами Конрада Геснера, он в своём труде распределяет 840 видов на 15 классов чисто ботанического характера. Сообщив в начале своего труда всё известное относительно организации явнобрачных растений, он основывает свою классификацию прежде всего на деревянистых или смолистых свойствах стебля (что позволяет ему установить 2 первые группы), затем, в первом случае, на положении зародыша в семени, во втором случае - на присутствии или отсутствии семян (мхи, лишайники и т. д.). Это даёт ему отделы второго порядка. Наконец, форма плода, верхняя или нижняя завязь, число семян, присутствие или отсутствие их покрова, форма корня и т. д. помогают ему определить 15 классов (которые, правда, классами не названы) и подразделить их на 47 секций. То значение, которое Чезальпино придаёт семенам, позволяет считать его прямым предшественником будущих классификаторов. Чезальпино использовал 4 категории жизненных форм Теофраста, но объединил их в 2: древесные (деревья и кустарники) и травянистые (полукустарники и травы). Важным признаком Чезальпино считал положение "души", которая, по его мнению, должна быть у растений скрыта в сердцевине, и "сердца" - в семени (он полагает, что оно находится в месте отхождения семядолей от гипокотиля). Далее используется число семян в плоде, строение перикарпия и отчасти соцветия.

Система классификации растений (Цезальпин различал такие классы растений):
Классы 1 и 2 обнимают деревья и кустарники, различая их по положению зародыша в семени. Сердце у верхушки семени. Семена чаще одиночные (Дуб, Липа, Лавр, Слива и др.).
Остальные классы обнимают полукустарники и травянистые растения.
Класс 3: Травянистые - единственное семя в плоде, например, Валериана, Крапива, Злаки.
Класс 4: Травянистые - несколько семян в одиночном мясистом плоде, например, Тыквенные, Спаржа.
Класс 5: несколько семян в сухом плоде, например, Бобовые, Гвоздичные и др.
Класс 6: два семени, до созревания слитые, цветы в зонтике: Зонтичные.
Класс 7: плод двугнёздный, например, Пролесник, Подмаренник, Табак, Капустные.
Класс 8: плод трёхгнёздный, с немясистым корнем, например, Молочай, Фиалка.
Класс 9: то же, но корень мясистый, например, Лилейные и др.
Класс 10: четыре семени на общем ложе (плод, распадающийся на 4 односемянные части): Бурачниковые, Яснотковые.
Классы 11 и 12 содержат Астровые, а также Синеголовник и Скабиоза с "общим цветком, распределённым частями на вершинах отдельных семян".
Класс 13: несколько семян в общем цветке: например, Лютик, Частуха.
Класс 14: несколько семян в одном плоде: например, Кислица, Аристолохия, Каперсы.
Класс 15: без цветов и плодов: споровые растения.

Большинство групп Чезальпино было составлено совершенно искусственно, но в некоторых случаях он интуитивно нащупал действительно существенные особенности строения и довольно удачно очертил объём, например, у зонтичных или бурачниковых вместе с губоцветными. Но, как правило, им бралось слишком мало признаков без оценки их относительной значимости, в результате система оказалась классификацией не столько растений, сколько признаков и их вариаций/.

Современника Додонса итальянского натуралиста Пьера Андреа Чезальпино называют основоположником настоящего научного подхода к изучению грибов. В труде "De Plantis libri XVI" Чезальпино впервые указал на особое положение грибов в царстве растений:

- "Среди всех растений природа грибов наиболее специфична".

Чезальпино выделил 3-и "класса" грибов - Tuber, или Tartufi - подземные; Pezicae - наземные грибы без ножки; Fungi - шляпочные грибы и трутовики. Последний класс был разделён на 16 "таксонов", наименования которых основывались на итальянских народных названиях. Например, для трубчатых грибов, которые теперь относятся к порядку болетовых, было взято название Suilli, или Porcini - "свиные грибы". В современной номенклатуре Suillus используется в качестве названия рода маслёнок.

Рисунок выше - /Карл Клузиус (1526-1609), (лат. Carolus Clusius или нидерл. Karl Clusius) или Шарль де Леклюз (фр. Charles de l’Écluse), 19 февраля 1526 - 4 апреля 1609) - нидерландский, французский или французско-нидерландский ботаник, 1-н из важнейших европейских ботаников XVI века, считающийся главным ботаником своего времени, центральная фигура в обширной европейской сети обменов растениями, основоположник голландской индустрии луковичных растений, профессор ботаники, миколог, "отец микологии", врач, натуралист (естествоиспытатель) и гуманист. Карл Клузиус родился в городе Аррас 19 февраля 1526 года в богатой, хорошо образованной католической семье. Отец Клузиуса, Мишель де Леклюз, был дворянином и служил советником в провинциальном суде Артуа. Учился Карл Клузиус в Швейцарии, в Германии и во Франции. Он изучал юриспруденцию и философию в Гентском университете. В начале 1550 года Клузиус провёл некоторое время в Швейцарии; в 1551 году он находился в Монпелье, занимаясь с профессором Гийомом Ронделе. Среда Монпелье с её богатством растений особенно подходила для развития и усиления склонностей Клузиуса к ботанике; за эти годы становления он изучил не менее восьми языков и получил обширные знания по широкому кругу вопросов. Карл Клузиус мог читать на фламандском, французском, немецком, греческом, итальянском, испанском и латинском языках. Он также занимался самостоятельным изучением португальского языка. Первой публикацией Клузиуса был французский перевод работы Ремберта Додунса "Cruydt-Boeck", опубликованный в Антверпене в 1557 году. Карл Клузиус был советником князей и аристократов в различных европейских странах. 1-н современник описывал Клузиуса как "отца всех красивых садов в Европе". На момент рождения Карла Клузиуса сады мало изменились с VIII века; Клузиус сыграл в их изменении значительную роль. Ботаника становилась самостоятельной дисциплиной и больше не рассматривалась как отрасль медицины; растения представляли интерес только из-за своих лекарственных и кулинарных свойств, а Клузиус был 1-м из 1-х в Северной Европе, кто признавал растения сами по себе, оценивая их красоту так же, как их использование. Карл Клузиус был приглашён в Вену для создания ботанического сада; он был директором ботанического сада в Вене (1573-1587) при дворе императора Максимилиана II. Покровительство императора дало ему возможность путешествовать по всей Европе, собирая информацию для своих ботанических исследований, и внедрить ряд новых растений за пределами Европы. 

Клузиус способствовал введению культуры картофеля в Европе, а также ввёл в Нидерландах тюльпаны. Считается также, что он ввёл в западноевропейское садоводство пионы и гиацинты. В 1593 году Клузиус стал почётным профессором ботаники в Лейдене; эту должность он занимал до своей смерти. 1-м из важных достижений Клузиуса стало создание Лейденского ботанического сада, второго подобного учреждения к северу от Альп. Он создал его в преклонном возрасте 67 лет. В Лейденском ботаническом саду Карл Клузиус посадил несколько луковиц тюльпанов, которые были присланы ему из Константинополя Бюсбеком - послом Священной Римской империи при дворе султана Сулеймана I. Несмотря на то, что тюльпаны были из Центральной Азии и к западу от Константинополя до этого не выращивались, они адаптировались к климатическим условиям северо-западной Европы. Весной 1594 года первые тюльпаны расцвели на севере Нидерландов. Это стало началом голландской индустрии луковичных растений. Карл Клузиус является автором инновационных, всемирно известных ботанических публикаций. Его считают "отцом микологии", потому что в 1601 году он написал первую монографию о грибах. Это было региональное описание грибной флоры Венгрии - "Fungorum in Pannoniis observatorum brevis historia", которое вышло в общем томе "Rariorum plantarum historia", получившем позднее название "Кодекса Клузиуса" ("Codex Clusianus"). Клузиус описал 47 "родов" и 105 "видов" грибов, снабдив описания довольно точными акварельными иллюстрациями. Большинство грибов из "Кодекса Клузиуса" можно достаточно точно идентифицировать по иллюстрациям. Карл Клузиус умер в Лейдене 4 апреля 1609 года. Карл Клузиус специализировался на микологии, а также на изучении растений и животных. Клузиус описал множество новых растений и животных Европы, Азии, Африки, Северной Америки и Южной Америки. Он впервые выделил некоторые семейства растений/.

Карл Клузиус в 1601 году написал 1-ю монографию, целиком посвящённую грибам. Это было региональное описание грибной флоры Венгрии - "Fungorum in Pannoniis observatorum brevis historia", которое вышло в общем томе "Rariorum plantarum historia", получившем позднее название "Кодекса Клузиуса". Клузиус описал 47 "родов" и 105 "видов" грибов, снабдив описания довольно точными иллюстрациями, в том числе цветными. Рисунки грибов в тот период, как правило, уступали по качеству рисункам цветковых растений. Большинство грибов из "Кодекса Клузиуса" можно, всё же, достаточно точно идентифицировать по иллюстрациям.

Рисунок выше - /Мальпиги, рисунок опухоли стебля боярышника (1675)/.

Рисунки из "Микрографии" Р.Гука - голубая плесень и ржавчина розы/.

Рисунок выше - /Ро́берт Гук (англ. Robert Hooke; Роберт Хук, 18 (28) июля 1635 - 3 (14) марта 1703) - английский естествоиспытатель и изобретатель. Член Лондонского королевского общества (1663). Гука смело можно назвать 1-м из "отцов физики", в особенности экспериментальной, но и во многих других науках ему принадлежат зачастую 1-ни из 1-х основополагающих работ и множество открытий. Отец Гука подготавливал его первоначально к духовной деятельности, но ввиду слабого здоровья Роберта и проявляемой им способности к занятию механикой предназначил его к изучению часового мастерства. Впоследствии, однако, молодой Гук проявил интерес к научным занятиям и вследствие этого был отправлен в Вестминстерскую школу, где успешно изучал языки (латинский, древнегреческий, иврит), но в особенности интересовался математикой и показал большую способность к физике и химии. Способность его к занятиям физикой и химией была признана и оценена учёными Оксфордского университета, в котором он стал заниматься с 1653 года. Он стал помощником химика Виллиса, а потом известного физика Роберта Бойля.

- C 1662 был куратором экспериментов при Лондонском Королевском обществе (с момента его создания).
- В 1663 Королевское общество, признав полезность и важность его открытий, сделало его своим членом.
- В 1677-1683 был секретарём этого общества.
- С 1664 - профессор Лондонского университета (профессор геометрии в Gresham College).
- В 1665 опубликовал книгу "Микрография" с описанием микроскопических и телескопических наблюдений, содержащую публикацию существенных открытий в биологии.
- С 1667 Гук читал "Кутлеровские лекции" по механике.../.

В опубликованной в 1664 году "Микрографии" Роберта Гука появляются 1-е рисунки микроскопических структур грибов - "голубой плесени" и "ржавчины розы". "Ржавчину розы" Гука можно идентифицировать как гриб рода Phragmidium, а "голубая плесень", вероятно, Aspergillus sp., хотя рисунок напоминает больше спорангии миксомицетов, чем конидиеносцы аспергилла. Гук только поверхностно описал обнаруженные структуры, не пытаясь дать им какое-либо научное трактование. Имеются изображения грибов и у другого пионера микроскопических исследований - М. Мальпиги. На его рисунке опухоли боярышника, сделанном в 1675 году, можно распознать ржавчинный гриб Gymnosporangium clavariiforme.

Рисунок выше - /Белый гриб в русском лечебнике XVII века/.

В России Самюэль Коллинз, английский придворный врач Алексея Михайловича написал небольшую книгу о "нынешнем состоянии России", которая была издана в 1671 году в Лондоне. В ней имеется 2-е таблицы рисунков "русских грибов", выполненных, однако, скорее лубочно. Во 2-й половине XVII - начале XVIII века в России появляется ряд травников и лечебников, часть из которых были переводными с западноевропейских языков, например, переведённая в 1672 году с немецкого "Книга Прохладный вертоград зовомая" или переведённая в 1705 году "Книга зовомая земледелательная<…> сложенная Агапием монахом критским<…> в Венетии 1674<…>". В переводных книгах содержатся сведения о грибах как о пище тяжёлой и причиняющей, особенно при частом употреблении, вред здоровью. В лечебнике 1672 года имеется рецепт полоскания горла молочным отваром гриба "уши Иудовы". В ещё 1-м лечебнике, точный год написания которого неизвестен, приводится подробное описание изготовления экстракта из белого гриба, применяемого при обморожениях II и III степени. Рисунок в этом лечебнике, вероятно, является первым изображением грибов, сделанным в России.

Рисунок выше - /М. Мальпиги (1628-1694). Марче́лло Мальпи́ги (итал. Marcello Malpighi; 10 марта 1628, Кревалькоре, Болонья - 29 ноября 1694, Рим) - итальянский биолог и врач. 1-н из основоположников микроскопической анатомии растений и животных, проводил исследования в области гистологии, эмбриологии и сравнительной анатомии. Член Лондонского королевского общества (1669). В 17 лет поступил в Болонский университет, окончил в 1653 году, получив степень доктора медицины. В 1656 году занял должность профессора в этом университете. Вскоре стал профессором теоретической медицины Пизанского университета и на три года переехал в Пизу. В Пизе познакомился с Джованни Борелли, оказавшим большое влияние на взгляды Мальпиги. Борелли развивал идеи ятрофизики, рассматривавшей физиологические и анатомические явления с точки зрения механики. В 1659 году Мальпиги вернулся в Болонью, с 1662 по 1666 годы был профессором университета в Мессине, затем был вынужден возвратиться обратно в Болонский университет, где преподавал практическую медицину до 1691 года. В 1691 году папа Иннокентий XII пригласил Мальпиги в Рим в качестве лечащего врача. Преподавал медицину в Папском колледже. Большинство результатов исследований Мальпиги публиковалось в журнале Лондонского королевского общества. Первая статья была опубликована в 1661 году. В 1667 году редактор журнала Лондонского королевского общества Генри Олденбург предложил Мальпиги вести регулярную переписку. Год спустя Мальпиги стал членом Лондонского королевского общества. В своих исследованиях Мальпиги одним из первых использовал микроскоп, дававший увеличение до 180 раз. Впервые наблюдал капилляры в лёгких и открыл связь между артериями и венами, что не удалось Уильяму Гарвею, описавшему большой и малый круги кровообращения. Исследуя строение шелковичного червя, открыл трахеи - органы дыхания членистоногих в виде маленьких воздухоносных трубочек, пронизывающих тело насекомого. Наблюдал почечные канальцы, заложив первые представления о мочеиспускании. Установил наличие восходящего и нисходящего токов веществ в растениях и высказал догадку о роли листьев как органов питания растений. Описал лимфатические тельца селезёнки, выделительные органы паукообразных, многоножек и насекомых, ростковый слой кожи, кровяные тельца, альвеолы лёгких, вкусовые сосочки языка, кишечные крипты и другое.

С помощью микроскопа обнаружил органы на стадиях развития цыплёнка, на которых ранее не удавалось видеть сформированные части зародыша. Развитие зародыша Мальпиги рассматривал с точки зрения идей преформизма, полагая, что зародыш уже находится в сформированном состоянии в яйце, а во время развития происходит лишь увеличение частей уже сформированного организма. Написал двухтомный труд "Анатомия растений" (1671, опубликован в 1675-1679 годах) - самое исчерпывающее на то время микроскопическое исследование анатомии растений. Здесь он описал клеточное строение растений (клетки - "мешочки" и "пузырьки") и выделил тип тканей - волокна. Его труд, вместе с трудом Неемии Грю, служил в течение более 100 лет единственным источником познаний об анатомии растений. Именем Мальпиги названы некоторые открытые им органы и структуры: мальпигиевы тельца (в почках и селезёнке), мальпигиев слой (в коже), мальпигиевы сосуды (у паукообразных, многоножек и насекомых). В растительном царстве в честь него назван род Malpighia Plum. ex L., от названия которого образованы названия таксонов более высокого ранга - подсемейства Malpighioideae, семейства Malpighiaceae и порядка Malpighiales. Помимо отдельных изданий работ, сочинения Мальпиги были собраны под названием "Opera omnia, seu, Thesaurus locupletissimus botanico-medico-anatomicus: viginti quator tractatus complectens et in duos tomos distributus, quorum tractatum seriem videre est dedicatione absoluta" (Лондон, 1686—1688, и Лейден, 1687); кроме того, были изданы "Opera posthuma, et vita a seipso scripta" (Лондон, 1697) и "Opera medica et anatomica varia" (Венеция, 1743). Мальпиги умер 30 ноября 1694 от инсульта/.

Учёных, непосредственно специализирующихся на микологии в XVII-XVIII веках ещё не было, грибы изучались только некоторыми ботаниками -систематиками попутно с цветковыми растениями. Для высших растений был уже накоплен значительный материал, позволивший к XVIII веку выделить некоторые естественные группы, принципов же, пригодных для естественной классификации грибов ещё не существовало. 

Рисунок выше - /С. Вейян (1669-1722). Себастья́н Вайя́н (фр. Sébastien Vaillant, 26 мая 1669 года - 20 мая 1722 года) - французский ботаник и миколог. Себастьян Вайян родился в муниципалитете Виньи 26 мая 1669 года. Он изучал ботанику в парижском Саду растений вместе с Турнефором. В 1716 году Себастьян Вайян был избран членом Французской академии наук. Вайян предложил критерий для классификации грибов, который вошёл в книгу De plantes, изданную в 1727 году, уже после смерти автора. Классификация Вайяна была основана на строении нижней поверхности шляпки, то есть гименофора. Такая классификация оказалась очень удобной и используется до сих пор при сборе грибов, а признаки строения гименофора, изучаемые современными методами, продолжают использоваться в систематике. Вайян обратил внимание на структуру грибов, связанную с их размножением, однако функция её в то время была неизвестной. Вайян писал, что:
- "Грибы - это дьявольское произведение, нарушающее общую гармонию Природы, чтобы смущать самых талантливых исследователей и приводить в отчаяние молодых ботаников".
Вайян занимался изучением цветка, доказывая, что главнейшими его частями являются пестик и тычинка. По мнению американского историка ботаники Эдварда Ли Грина, Вайян своими исследованиями совершил:
-"Самое большое из многих дел, которое он совершил для ботаники".
Эти исследования были положены Карлом Линнеем в основу своей "половой системы классификации растений" - "Системы Линнея", опубликованной в 1735 году. Себастьян Вайян умер в Париже 26 мая 1722 года/.

С. Вейян (1669-1722) предложил критерий для классификации грибов, который вошёл в книгу "De plantes", изданную в 1727 году, уже после смерти автора. Классификация Вейяна была основана на строении нижней поверхности шляпки, т.е. гименофора. Такая классификация оказалась очень удобной и используется до сих пор при сборе грибов, а признаки строения гименофора, изучаемые современными методами, продолжают использоваться в систематике. Вейян обратил внимание на структуру грибов, связанную с их размножением, однако функция её была неизвестной, да и о размножении грибов вообще не было известно ничего. Вейян вряд ли верил в народные легенды о появлении грибов от удара молнии, из гнили, росы, даже от тени, но объяснить, как они размножаются, не мог.

Рисунки выше - /Сфероболусы, рис. П.А.Микели/.

Рисунок выше - /П.А.Микели (1679-1737). Пьер Антонио Микели (итал. Pier Antonio Micheli; 1679-1737) - итальянский ботаник и миколог, "отец криптогамии". Пьер Антонио Микели родился во Флоренции 11 декабря 1679 года в семье Пьера Франческо ди Паоло и Марии ди Пьеро Сильвестри. В 1694 году, в возрасте 14 лет, Микели стал работать в книжном магазине О. Ф. Буонайути, где он мог читать ботаническую литературу. Микели познакомился с В. Фалуджи, валломброзским аббатом, затем сам переехал в Валломброзу. Там он познакомился с микологами Б. Бьяджи и Б. Тоцци (1656-1743). Л. Магалотти представил Микели Козимо III, с 1703 по 1710 Микели активно путешествовал при поддержке великого герцога. В 1706 году он был назначен директором Флорентийского ботанического сада и профессором Пизанского университета. В 1716 году Пьер основал Флорентийское ботаническое общество. С 1726 по 1734 Микели продолжал путешествовать при поддержке герцога Джана Гастоне. В 1729 году Микели издал книгу Nova plantarum genera - 1-ну из важнейших работ для микологии. В этой работе Микели описал 1900 видов растений и грибов. Также в ней впервые описаны такие роды как Polyporus, Mucor, Aspergillus, Botrytis, Clathrus. Микели - первый учёный, заметивший, что органами размножения грибов являются споры. В 1736 году Пьер Микели совершил поездку на гору Бальдо, после чего у него начался плеврит. 1 или 2 января 1737 года он скончался. Большая часть образцов, собранных Микели, находится в гербарии Флорентийского университета в Музее естественной истории во Флоренции (FI). Кроме образцов Микели в этом гербарии также хранятся образцы Иоганнеса Шойхцера (1684-1738), Джеймса Петивера (1658-1718) и Уильяма Шерарда (1659-1728)/.

В 1729 году эту тайну частично разгадал П. А. Микели, обнаруживший у грибов микроскопические "семена", прорастающие, если поместить их в каплю воды. Микели описал у грибов и микроскопические "цветки без тычинок и венчика", вероятно, эти структуры были на самом деле цистидами или базидиями без спор. Кроме того, Микели впервые сделал научные описания микроскопических грибов, некоторые введённые им роды принимаются и в современной таксономии (Aspergillus, Botrytis, Mucor), а также изучил механизм распространения гриба Sphaerobolus stellatus, выстреливающего из плодового тела перидиоль со спорами. Споры Микели называл "семенами", а перидиоль - "плодом" этого гриба. В 1778 году И. Хедвиг показал, что "семена" криптогамов принципиально отличаются от семян цветковых растений и предложил для них название споры.

Рисунок выше - /К.Линней (1707-1778). Карл Линне́й, реже Карл Линнеус (швед. Carl Linnaeus, Carl Linné, лат. Carolus Linnaeus, после получения дворянства в 1761 году - Карл фон Линней, Carl von Linné; 23 мая 1707, Росхульт - 10 января 1778, Уппсала) - шведский естествоиспытатель (ботаник, зоолог, минералог) и медик. Учился в Лундском, затем Уппсальском университете. В 1732 году в одиночку совершил научное путешествие в Лапландию, преодолев за пять месяцев более 2000 км. Несколько лет жил в Голландии, где защитил докторскую диссертацию и опубликовал ряд ботанических и общебиологических работ, в короткий срок сделавших его известным во всём. С 1741 года до конца жизни - профессор Уппсальского университета/.

Карл Линней непосредственно в микологию не сделал большого вклада. Он значим для этой науки, как и для биологии вообще, как основоположник биологической номенклатуры и современных принципов классификации. Отчасти благодаря авторитету Линнея грибы долгое время входили в царство растений. Сам Линней поначалу высказывал сомнения в принадлежности грибов к растениям и предлагал относить их вместе с полипами к животным. После открытия Микели грибных "семян", Линней окончательно склонился к признанию грибов растениями. Линней выделил порядок Грибы (Fungi), включивший 10 родов и 86 видов, также некоторые грибные организмы - дрожалки, лишайники, кортициоидные грибы - были в системе Линнея отнесены к водорослям. В последних прижизненных изданиях "Системы природы" Линней объединил грибы, водоросли, мхи и папоротники в отдельный класс криптогамных, или тайнобрачных растений. Хотя с точки зрения систематики этот термин устарел, данную группу организмов и в настоящее время часто называют "криптогамами". Представители научной школы Линнея, как непосредственные его ученики, так и последователи, сделали значительный вклад в развитие микологии. Я. Ф. Эрхарт в 1793 году издал 1-й в истории эксикат (тиражированный гербарий), в который вошли несколько видов грибов. Э. Ахариус в 1798-1814 годах разработал 1-ю подробную систему лишайников и положил начало новому разделу биологических наук - лихенологии. Г. Ф. Линк непосредственно продолжал работу Линнея по систематике и в 1824—1825 годах подготовил для 4-го издания "Species plantarum" описания новых видов грибов. Место грибов в системе живого мира, указанное Линнеем, удовлетворило всё же не всех учёных. О. фон Мюнхгаузен предложил грибы вместе с полипами выделить в "промежуточное царство" / Regnum Intermedium/, а в 1795 году Ж. Поле впервые использовал термин "микология". Автором термина называют также английского ботаника М.Дж.Беркли, который употреблял его только с 1836 года. Беркли же, с 1860 года в некоторых своих работах употреблял термин фунгология. Х.Неес фон Эзенбек в 1816 году впервые предложил выделить "Царство грибов" / Regnum Mycetoideum/, его приоритет, однако, был надолго забыт.

В 1724 году была основана Петербургская академия наук, и сразу же в России начались научные ботанические исследования, в том числе и исследования грибов. Первыми задачами перед ботаниками в России стали поиск и учёт полезных растений, для чего снаряжались экспедиции в отдалённые местности Российской империи. Руководили экспедициями как иностранные академики, так и первые русские исследователи — И. Х. Буксбаум, С. П. Крашенинников, И. Г. Гмелин, П. С. Паллас, И. Г. Георги, И. И. Лепёхин, В. Ф. Зуев, Н. Я. Озерецковский, И. П. Фальк и другие. Из работ, в которых имеются флористические списки грибов, отмечают:

"Plantarum minus cognitarum centuria complectens plantas circa Bysantium et in Oriente observatarum" И.Х.Буксбаума, опубликованную в 1728-1740 годах,
"Описание земли Камчатки" (1754-1755) С.П.Крашенинникова,
его же "Index plantarum circa Petropolin sponte crescentia et a 1749 observatorum" и "Flora ingrica contines plantas inter Petropolin, Novogradium et Narvam urbe sponte nascentes" (эти труды не были опубликованы, но в 1861 году полностью использованы в работе Д.Гортера "Flora ingrica ex schedis St. Kraschrninnikov confecta et propriis observationibus aucta").
"Flora sibirica sive historia plantarum Sibiriae" (1747-1759) И.Г.Гмелина (напечатаны, однако, были 4 тома, а пятый, который и содержит сведения о грибах, хранится в архиве РАН в виде рукописи),
"Reise durch verschiedene Provinzen des Russischen Reichs" (1771-1773) П.С.Палласа,
"Beytrage zur topographischen Kenntniss des Russischen Reichs" (1786) И.П.Фалька,
"Reisen durch Russland und Caucasischen Gebirge" (1787) И.А.Гюльденштедта,
"Повествовательное, землемерное и естествославное описание Очаковския земли" (1794) А. Мейера,
труды И.Г.Георги "Bemerkungen einer Reise in Russischen Reich" (1775) и "Geographisch-physikalische und naturhistorische Beschreibung des Russischen Reichs" (1800).
Обычно в этих работах приводились описания от нескольких видов грибов до нескольких десятков видов, в сводке Георги (1800) - почти 200. Первые описания были кратки и несовершенны, могли приводиться только списки названий без описаний, поэтому некоторые из отмеченных в работах XVIII века грибов теперь трудно идентифицировать, даже если они сопровождаются рисунками.

1-м трудом, написанным русским учёным и посвящённым исключительно грибам называли некий неопубликованный, а затем утерянный "список из 430 видов грибов" С.П.Крашенинникова, указанный Р. Э.Траутфеттером в его "Florae Rossicae fontes". Траутфеттер, однако, не указал никаких источников того, что этот список действительно существовал, и больше нигде такая работа Крашенинникова не упоминается. В трудах этого автора, опубликованных затем Д.Гортером, содержатся описания около 40 видов грибов, а в "Описании земли Камчатки" имеются первые сведения об употреблении местными племенами мухоморов в качестве опьяняющего средства. Кроме экспедиционных отчётов и периодических изданий Академии наук ("Академические известия", "Новые ежемесячные сочинения"), в России начали появляться и внеакадемические издания, из которых особый интерес представляют журналы, издаваемые А.Т.Болотовым - "Сельской житель…" и приложение к "Московским ведомостям" - "Экономический магазин". В них публиковались статьи практического содержания. В частности, Болотовым (он был и автором многих статей в своих изданиях) в 1780-1789 годах написан ряд статей о шампиньонах, в которых описаны признаки отличия этих грибов от бледной поганки, даются сведения по выращиванию, хранению и кулинарии, также имеются статьи о трюфелях, сморчках и некоторых лечебных грибах - дождевике и подземном "оленьем грибе" (вероятно, Elaphomyces granulatus).

В последние годы XVIII - 1-й половине XIX века флористические исследования стали массовыми, хотя финансируемые государством академические экспедиции прекратились. Исследования стали проводиться вблизи мест, где работали учёные, начали появляться работы, специально посвящённые грибам. К 1850-м годам появились флористические списки грибов Прибалтийских, Московской и Петербургской губерний, Поволжья, Украины, Бессарабии, Крыма, Арктики. Особое значение из работ этого периода имеет труд И. А. Вейнмана "Hymeno et Gasteromycetes hujusque in imperio Rossico observatas recensuit" ("Гимено- и гастеромицеты, наблюдавшиеся в Российской империи"), изданный в 1836 году. Это была первая капитальная сводка по грибной флоре России, в которую вошли 1132 вида с указанием синонимов и местонахождений, кратким описанием условий местообитания. Впервые в России Вейнманом была последовательно использована система грибов Э. Фриса. Около 100 видов, вошедших в эту монографию, описано самим Вейнманом. В последующие годы работа Вейнмана была продолжена рядом учёных. В.М.Черняев в 1845 году описал на Украине 5 новых родов гастеромицетов, три из которых приняты и в современной таксономии (Disciseda, Trichaster и Endoptychum). И.Г.Борщов составил сводки по грибным флорам и описал новые виды из Петербургской губернии, арктической Сибири, Арало-Каспийского края, Черниговской губернии. В 1855-1856 годах Борщовым написана рукопись "Mycologia Petropolitana", содержащая описания и акварельные рисунки 200 видов грибов, однако, эта работа не была издана.

"Фитопатология" - раздел биологии и сельского хозяйства, изучающий развитие, размножение фитопатогенов на растениях, методы защиты от поражения. Тесно связана с "микологией", т.к. среди микологических объектов выделяют большое количество фитопатогенов.