Чтобы понять причину, надо знать физиологию прорастания.

Когда семечко в почве дает корешок, оно начинает производить газ этилен. Это гормон роста и созревания. Газ держится сверху. Росток начинает расти в сторону газа. Землю он раздвигает твердой шапочкой семени. Как только пробьется, концентрация этилена сразу падает. Это сигнал, что шапочку надо скидывать и открывать листья.

Проросшие семена надо сеять гораздо меньше по глубине, особенно если росток уже разворачивается. Он сбросит шапочку и пробиться через почву не сможет. Лучше всего сеять как только показался самый кончик корешка.

А сильно проросшие сажают так, чтобы кончик с листочками торчал из земли.

Еще причина - слишком рыхлая почва. Если росток попадет в полость, этилен рассеется. Росток сбросит шапочку и дальше не пробьется.
Поэтому перед посевом почву поливают и уплотняют.